NGS Analysis Workbench
Analyseer sequencingdata
- Capaciteiten
- Interactive, Read, Write
- Categorie
- Gegevens
- Ontwikkelaar
- OpenAI
- Website
- (opent in een nieuw venster)
Hoe het werkt
Een NGS-werkomgeving die je stapsgewijs begeleidt bij FASTQ-kwaliteitscontrole, bulk-RNA-seq en single-cell-RNA-seq. Gespecialiseerde vaardigheden bepalen het startpunt van de gebruiker, maken een ontwerp gericht op een wetenschappelijk resultaat en koppelen dat ontwerp aan de actuele mogelijkheden van Nextflow/nf-core of Snakemake. Ze behouden de ingebouwde, aan checksums gekoppelde goedkeuring en interpreteren afgeronde resultaten op basis van bewijs in bestanden.
Wat kun je nog meer doen?
Beoordeel de sequencingkwaliteit
NGS Analysis Workbench Inspecteer deze sequencing-invoer en verduidelijk het analysedoel. Kies een ondersteunde QC-workflow, controleer de vereisten en interpreteer de afgeronde rapporten aan de hand van opgeslagen artefacten.
Plan een RNA-sequencinganalyse
NGS Analysis Workbench Beoordeel de invoer en opzet van dit bulk-RNA-seq-onderzoek. Beveel een ondersteunde analyseworkflow aan, identificeer ontbrekende metadata en leg uit welke controles vóór de uitvoering nodig zijn.
Interpreteer sequencingresultaten
NGS Analysis Workbench Beoordeel deze resultaten van de afgeronde sequencinganalyse. Vat kwaliteitsproblemen en resultaten samen, maak onderscheid tussen bevindingen en aannames en verwijs naar de onderbouwende bestanden.
Wat is inbegrepen
Skills
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Resources
De NGS Analysis Workbench-plug-in toevoegen in een paar klikken
De beschikbaarheid hangt af van de plug-in, je abonnement en de instellingen van je werkruimte. Voor sommige verbindingen is configuratie of goedkeuring door een beheerder vereist. Neem contact op met de beheerder van je werkruimte als toegang is geblokkeerd.
Gerelateerde plug-ins verkennen
Data
Zet data om in heldere beslissingen.
Life Sciences Literature
Vind biomedische artikelen, preprints en vrij toegankelijke volledige teksten
Life Sciences NGS Analysis
Begeleide NGS-routering en lokale uitvoering van sequencinganalyses
BioRender
Figuren zoeken en maken
Documents
Documenten maken en bewerken
Zotero
Vind artikelen en voeg bronverwijzingen uit Zotero toe
