- 機能
- Interactive, Read, Write
- カテゴリー
- データ
- 開発者
- OpenAI
- Webサイト
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仕組み
FASTQ の品質管理（QC）、バルク RNA-seq、シングルセル RNA-seq に対応し、解析の全過程を支援する NGS ワークベンチです。用途別のスキルがユーザーの現状を把握し、科学的な成果に向けて解析を設計します。その設計を実際に利用可能な Nextflow/nf-core または Snakemake の機能に結び付け、チェックサムに紐付いたネイティブの承認を保持し、ファイルに記録された根拠に基づいて解析結果を解釈します。
ほかにできること
シーケンシング品質の確認
NGS Analysis Workbench これらのシーケンシング入力データを確認し、解析の目標を明確にしてください。対応している QC ワークフローを選び、前提条件を確認し、保存済みの成果物を使って完成したレポートを解釈してください。
RNA シーケンシング解析の計画
NGS Analysis Workbench このバルク RNA-seq 研究の入力データと研究デザインを確認してください。対応している解析ワークフローを提案し、不足しているメタデータを特定して、実行前に必要な確認事項を説明してください。
シーケンシング結果の解釈
NGS Analysis Workbench これらの完了したシーケンシング解析の出力を確認してください。品質上の問題と結果を要約し、知見と仮定を区別して、根拠となるファイルを示してください。
含まれる内容
スキル
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
リソース
数回のクリックでNGS Analysis Workbenchプラグインを追加
利用可否は、プラグイン、ご利用プラン、ワークスペースの設定によって異なります。一部の接続では、管理者による設定または承認が必要です。アクセスがブロックされている場合は、ワークスペースの管理者にお問い合わせください。
