Life Sciences NGS Analysis
Orientim i udhëzuar NGS dhe ekzekutim lokal për analizën e sekuencimit
- Aftësitë
- Interactive, Read, Write
- Kategoria
- Arsim
- Zhvillues
- OpenAI
- Uebsajt
- (hapet në një dritare të re)
Si funksionon
Një shtesë e udhëzuar për marrjen e të dhënave hyrëse, orientimin dhe ekzekutimin e proceseve të sekuencimit të gjeneratës së ardhshme. Ajo ndihmon Codex të shqyrtojë të dhënat lokale të sekuencimit, të bëjë vetëm pyetjet e nevojshme specifike për testin, të zgjedhë kur është e mundur paketa publike ose me qasje falas që instalohen gjatë ekzekutimit, të kontrollojë disponueshmërinë e mjeteve ekzistuese para çdo instalimi dhe të ekzekutojë proceset lokale të mbështetura me verifikime, regjistra, manifeste, raporte QC dhe indekse të artefakteve. Ajo përfshin aftësi më të avancuara vendimmarrjeje për demultipleksimin BCL, ekzekutimin dhe interpretimin e QC-së së FASTQ-së, variantet e ADN-së të linjës germinale, somatike dhe të paneleve UMI, gjenerimin e numërimeve dhe shprehjen diferenciale për RNA-seq në masë, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag, si dhe QC-në e integruar pas numërimit për scRNA-seq.
Çfarë tjetër mund të bësh?
Shqyrto cilësinë e sekuencimit
Analiza NGS në shkencat e jetës Shqyrto këto të dhëna hyrëse të sekuencimit dhe qartëso synimin e analizës. Zgjidh një proces QC të mbështetur, kontrollo parakushtet dhe interpreto raportet e përfunduara bashkë me artefaktet e ruajtura.
Planifiko analizën e sekuencimit të ARN-së
Analiza NGS në shkencat e jetës Shqyrto të dhënat hyrëse dhe projektimin e këtij studimi RNA-seq në masë. Rekomando një proces analize të mbështetur, përcakto metadatat që mungojnë dhe shpjego kontrollet e nevojshme para ekzekutimit.
Interpreto rezultatet e sekuencimit
Analiza NGS në shkencat e jetës Shqyrto këto rezultate të përfunduara të analizës së sekuencimit. Përmblidh problemet e cilësisë dhe rezultatet, dallo gjetjet nga supozimet dhe cito skedarët mbështetës.
Çfarë përfshihet
Aftësitë
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 më shumë
Burimet
Shto shtesën Life Sciences NGS Analysis me pak klikime
Disponueshmëria varet nga shtesa, plani dhe cilësimet e tua të hapësirës së punës. Disa lidhje kërkojnë konfigurim ose miratim nga administratori. Kontakto administratorin e hapësirës sate të punës nëse aksesi është i bllokuar.
Eksploro shtesat përkatëse
Data
Shndërroji të dhënat në vendime të qarta.
Life Sciences Literature
Gjeni punime biomjekësore, parapublikime dhe tekst të plotë me qasje të hapur
NGS Analysis Workbench
Analizoni të dhënat e sekuencimit
BioRender
Gjeni dhe krijoni figura
Documents
Krijoni dhe redaktoni dokumente
Zotero
Gjej punime dhe shto citime nga Zotero
