Life Sciences NGS Analysis
Acheminement guidé et exécution locale d’analyses de séquençage SNG
- Fonctionnalités
- Interactive, Read, Write
- Catégorie
- Éducation
- Développeur
- OpenAI
Comment ça marche
Un plugiciel guidé de collecte, d’acheminement et d’exécution pour les flux de travail de séquençage de nouvelle génération. Il aide Codex à examiner les données de séquençage locales, à poser uniquement les questions manquantes propres au test, à choisir si possible des logiciels publics ou librement accessibles et installables à l’exécution, à vérifier la disponibilité des outils avant toute installation et à exécuter les flux de travail locaux pris en charge avec validation, journaux, manifestes, rapports de CQ et index des artefacts. Il comprend des capacités décisionnelles avancées pour le démultiplexage BCL, l’exécution et l’interprétation du CQ des fichiers FASTQ, les variants d’ADN germinaux, somatiques et de panels UMI, la génération de comptages et l’expression différentielle en RNA-seq en vrac, l’ATAC-seq, le ChIP-seq, le CUT&RUN, le CUT&Tag et le CQ intégré après comptage en scRNA-seq.
Que pouvez-vous faire d’autre?
Évaluer la qualité du séquençage
Analyse SNG en sciences de la vie Examinez ces données de séquençage et précisez l’objectif de l’analyse. Choisissez un flux de CQ pris en charge, vérifiez les prérequis et interprétez les rapports produits avec les artefacts enregistrés.
Planifier l’analyse du séquençage d’ARN
Analyse SNG en sciences de la vie Examinez les données et la conception de cette étude RNA-seq en vrac. Recommandez un flux d’analyse pris en charge, relevez les métadonnées manquantes et expliquez les vérifications requises avant l’exécution.
Interpréter les résultats de séquençage
Analyse SNG en sciences de la vie Examinez les résultats produits par ces analyses de séquençage. Résumez les problèmes de qualité et les résultats, distinguez les constatations des hypothèses et citez les fichiers justificatifs.
Ce qui est inclus
Compétences
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 de plus
Ressources
Ajouter le plugiciel Life Sciences NGS Analysis en quelques clics
La disponibilité dépend du plugiciel, de votre forfait et des paramètres de votre espace de travail. Certaines connexions nécessitent une configuration ou l’approbation d’un administrateur. Communiquez avec l’administrateur de votre espace de travail si l’accès est bloqué.
Explorer les plugiciels connexes
Data
Transformez les données en décisions claires.
Life Sciences Literature
Trouvez des articles biomédicaux, des prépublications et des textes intégraux en libre accès
NGS Analysis Workbench
Analyser des données de séquençage
BioRender
Trouver et créer des figures
Documents
Créer et modifier des documents
Zotero
Trouvez des articles et ajoutez des citations depuis Zotero
