NGS Analysis Workbench
تحلیل دادههای توالییابی
- قابلیتها
- Interactive, Read, Write
- دستهبندی
- داده
- توسعهدهنده
- OpenAI
چگونگی عملکرد
میزکار NGS با تمرکز بر مسیر تحلیل، برای کنترل کیفیت FASTQ، توالییابی RNA تودهای و توالییابی RNA تکسلولی. مهارتهای تخصصی نقطهٔ شروع کاربر را مشخص میکنند، طرحی برای رسیدن به نتیجهٔ علمی میسازند و آن را به قابلیتهای فعال Nextflow/nf-core یا Snakemake متصل میکنند. همچنین، تأیید درونسامانهای وابسته به چکسام را حفظ میکنند و نتایج نهایی را بر اساس شواهد موجود در فایلها تفسیر میکنند.
چه کارهای دیگری میتوانید انجام دهید؟
بررسی کیفیت توالییابی
میزکار تحلیل NGS، این ورودیهای توالییابی را بررسی و هدف تحلیل را روشن کن. یک گردشکار کنترل کیفیتِ پشتیبانیشده انتخاب کن، پیشنیازها را بررسی کن و گزارشهای نهایی را با استفاده از فایلهای خروجی ذخیرهشده تفسیر کن.
برنامهریزی تحلیل توالییابی RNA
میزکار تحلیل NGS، ورودیها و طراحی این مطالعهٔ RNA-seq تودهای را بررسی کن. یک گردشکار تحلیلیِ پشتیبانیشده پیشنهاد بده، فرادادههای ناقص یا ناموجود را مشخص کن و بررسیهای لازم پیش از اجرا را توضیح بده.
تفسیر نتایج توالییابی
میزکار تحلیل NGS، این خروجیهای نهایی تحلیل توالییابی را بررسی کن. مشکلات کیفی و نتایج را خلاصه کن، یافتهها را از فرضیات تفکیک کن و به فایلهای حاوی شواهد ارجاع بده.
مواردی که شامل میشود
مهارتها
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
منابع
افزودن افزونهٔ NGS Analysis Workbench تنها با چند کلیک
در دسترس بودن این قابلیت به افزونه، طرح شما و تنظیمات فضای کاری بستگی دارد. بعضی از اتصالها فقط با راهاندازی یا تأیید مدیر قابل استفادهاند. اگر دسترسی شما مسدود شده است، با مدیر فضای کاری خود تماس بگیرید.
کاوش افزونههای مرتبط
Data
دادهها را به تصمیمهای روشن تبدیل کنید.
Life Sciences Literature
مقالات زیستپزشکی، پیشچاپها و متن کامل با دسترسی آزاد را پیدا کنید
Life Sciences NGS Analysis
مسیریابی هدایتشدهٔ NGS و اجرای محلی تحلیل توالییابی
BioRender
یافتن و ساختن شکلها
Documents
ایجاد و ویرایش اسناد
Zotero
مقالهها را در Zotero پیدا کنید و به آنها ارجاع دهید
