Life Sciences NGS Analysis
مسیریابی هدایتشدهٔ NGS و اجرای محلی تحلیل توالییابی
- قابلیتها
- Interactive, Read, Write
- دستهبندی
- آموزش
- توسعهدهنده
- OpenAI
چگونگی عملکرد
افزونهای هدایتشده برای دریافت اطلاعات، مسیریابی و اجرای گردشکارهای توالییابی نسل جدید. این افزونه به Codex کمک میکند ورودیهای محلی توالییابی را بررسی کند، فقط پرسشهای بیپاسخ و مختص سنجش را بپرسد، در صورت امکان بستههای عمومی یا رایگانی را انتخاب کند که هنگام اجرا قابل نصباند، پیش از هر نصب وجود ابزارهای لازم را بررسی کند و گردشکارهای محلی پشتیبانیشده را همراه با اعتبارسنجی، گزارشهای رویداد، مانیفستها، گزارشهای کنترل کیفیت و نمایهٔ فایلهای خروجی اجرا کند. همچنین قابلیتهای پیشرفتهٔ تصمیمگیری برای تفکیک نمونههای BCL، اجرا و تفسیر کنترل کیفیت FASTQ، شناسایی واریانتهای DNA ژرملاین، سوماتیک و پنل UMI، تولید شمارش و تحلیل بیان افتراقی RNA-seq تودهای، ATAC-seq، ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag و کنترل کیفیت تعبیهشدهٔ scRNA-seq پس از شمارش را ارائه میدهد.
چه کارهای دیگری میتوانید انجام دهید؟
بررسی کیفیت توالییابی
تحلیل NGS علوم زیستی: این ورودیهای توالییابی را بررسی و هدف تحلیل را روشن کنید. یک گردشکار کنترل کیفیت پشتیبانیشده انتخاب کنید، پیشنیازها را بسنجید و گزارشهای تکمیلشده را با توجه به خروجیهای ذخیرهشده تفسیر کنید.
برنامهریزی تحلیل توالییابی RNA
تحلیل NGS علوم زیستی: ورودیها و طراحی این مطالعهٔ RNA-seq تودهای را بررسی کنید. یک گردشکار تحلیلی پشتیبانیشده پیشنهاد دهید، فرادادههای ناقص را مشخص کنید و بررسیهای لازم پیش از اجرا را توضیح دهید.
تفسیر نتایج توالییابی
تحلیل NGS علوم زیستی: خروجیهای تکمیلشدهٔ این تحلیل توالییابی را بررسی کنید. مشکلات کیفی و نتایج را خلاصه کنید، یافتهها را از فرضیات متمایز سازید و به فایلهای پشتیبان ارجاع دهید.
مواردی که شامل میشود
مهارتها
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- ۱۰ بیشتر
منابع
افزودن افزونهٔ Life Sciences NGS Analysis تنها با چند کلیک
در دسترس بودن این قابلیت به افزونه، طرح شما و تنظیمات فضای کاری بستگی دارد. بعضی از اتصالها فقط با راهاندازی یا تأیید مدیر قابل استفادهاند. اگر دسترسی شما مسدود شده است، با مدیر فضای کاری خود تماس بگیرید.
کاوش افزونههای مرتبط
Data
دادهها را به تصمیمهای روشن تبدیل کنید.
Life Sciences Literature
مقالات زیستپزشکی، پیشچاپها و متن کامل با دسترسی آزاد را پیدا کنید
NGS Analysis Workbench
تحلیل دادههای توالییابی
BioRender
یافتن و ساختن شکلها
Documents
ایجاد و ویرایش اسناد
Zotero
مقالهها را در Zotero پیدا کنید و به آنها ارجاع دهید
