NGS Analysis Workbench

Sequenzierungsdaten analysieren

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Fähigkeiten: Interactive, Read, Write
Kategorie: Daten
Entwickler: OpenAI
Website: (wird in einem neuen Fenster geöffnet)

NGS Analysis Workbench run a FastQC and Salmon QC on a public RNA-seq dataset and provide an interpretation of the results.

So funktioniert es

Eine am Analyseablauf orientierte NGS-Arbeitsumgebung für FASTQ-Qualitätskontrolle, Bulk-RNA-seq und Einzelzell-RNA-seq. Spezialisierte Skills ermitteln deinen Ausgangspunkt, planen die Analyse mit Blick auf ein wissenschaftliches Ergebnis und verknüpfen den Plan mit aktuell verfügbaren Funktionen von Nextflow/nf-core oder Snakemake. Sie bewahren die prüfsummengebundene systemeigene Freigabe und interpretieren abgeschlossene Ergebnisse anhand dateibasierter Belege.

Was kannst du sonst noch tun?

Sequenzierungsqualität prüfen
NGS Analysis Workbench Inspect these sequencing inputs and clarify the analysis goal. Choose a supported QC workflow, check prerequisites, and interpret the completed reports with saved artifacts.
In ChatGPT Work ausprobieren(wird in einem neuen Fenster geöffnet)
RNA-Sequenzierungsanalyse planen
NGS Analysis Workbench Review this bulk RNA-seq study's inputs and design. Recommend a supported analysis workflow, identify missing metadata, and explain checks needed before execution.
In ChatGPT Work ausprobieren(wird in einem neuen Fenster geöffnet)
Sequenzierungsergebnisse interpretieren
NGS Analysis Workbench Review these completed sequencing-analysis outputs. Summarize quality issues and results, distinguish findings from assumptions, and reference the supporting files.
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Das ist enthalten

Skills

Design NGS Analysis
NGS Analysis Workbench
Run NGS Analysis
Understand NGS Data
Understand NGS Results

Ressourcen

Das Plugin NGS Analysis Workbench mit wenigen Klicks hinzufügen

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