Life Sciences NGS Analysis

Geführtes NGS-Routing und lokale Ausführung von Sequenzierungsanalysen

Plugin installieren Vertrieb kontaktieren

Fähigkeiten: Interactive, Read, Write
Kategorie: Bildung
Entwickler: OpenAI
Website: (wird in einem neuen Fenster geöffnet)

Life Sciences NGS Analysis Clarify the NGS analysis goal, inspect available inputs and tools, select a suitable pipeline, and run supported local workflows with pre-execution checks and saved artifacts.

So funktioniert es

Ein Plugin zur geführten Erfassung, zum Routing und zur Ausführung von Workflows für die Sequenzierung der nächsten Generation. Es hilft Codex dabei, lokale Sequenzierungseingaben zu prüfen, nur noch offene assayspezifische Fragen zu stellen, möglichst öffentliche oder frei zugängliche und zur Laufzeit installierbare Pakete auszuwählen, vor jeder Installation die Verfügbarkeit vorhandener Tools zu prüfen und unterstützte lokale Workflows mit Validierung, Protokollen, Manifesten, QC-Berichten und Artefaktindizes auszuführen. Es bietet fundierte Entscheidungsfunktionen für die BCL-Demultiplexierung, die Ausführung und Interpretation der FASTQ-QC, Keimbahn-, somatische und UMI-Panel-DNA-Varianten, die Generierung von Zählwerten und die Analyse differentieller Expression bei Bulk-RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag sowie die integrierte scRNA-seq-QC nach der Zählung.

Was kannst du sonst noch tun?

Sequenzierungsqualität prüfen
Life Sciences NGS Analysis Inspect these sequencing inputs and clarify the analysis goal. Choose a supported QC workflow, check prerequisites, and interpret the completed reports with saved artifacts.
In ChatGPT Work ausprobieren(wird in einem neuen Fenster geöffnet)
RNA-Sequenzierungsanalyse planen
Life Sciences NGS Analysis Review this bulk RNA-seq study's inputs and design. Recommend a supported analysis workflow, identify missing metadata, and explain checks needed before execution.
In ChatGPT Work ausprobieren(wird in einem neuen Fenster geöffnet)
Sequenzierungsergebnisse interpretieren
Life Sciences NGS Analysis Review these completed sequencing-analysis outputs. Summarize quality issues and results, distinguish findings from assumptions, and reference the supporting files.
In ChatGPT Work ausprobieren(wird in einem neuen Fenster geöffnet)

Das ist enthalten

Skills

Amplicon Microbiome
NGS Router
ATAC-seq Peaks QC
BCL to FASTQ
Bulk RNA-seq
Bulk RNA-seq Counts
Bulk RNA-seq DE
ChIP/CUT&RUN Peaks QC
10 mehr

Ressourcen

Das Plugin Life Sciences NGS Analysis mit wenigen Klicks hinzufügen

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Installiere das Plugin und folge anschließend den Aufforderungen, um Berechtigungen zu prüfen und die erforderlichen Apps zu verbinden.

Starte einen neuen Chat in ChatGPT Work oder Codex, beschreibe das gewünschte Ergebnis und bitte ChatGPT, dafür Plugins zu verwenden.

Die Verfügbarkeit hängt vom Plugin, deinem Tarif und den Workspace-Einstellungen ab. Für einige Verbindungen ist eine Einrichtung oder Genehmigung durch einen Admin erforderlich. Wenn der Zugriff blockiert ist, wende dich an deinen Workspace-Admin.

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