- ความสามารถ
- Interactive, Read, Write
- ประเภท
- ข้อมูล
- นักพัฒนา
- OpenAI
- เว็บไซต์
- (เปิดในหน้าต่างใหม่)
วิธีการทำงาน
เวิร์กเบนช์ NGS ที่นำทางเป็นขั้นตอนสำหรับการควบคุมคุณภาพ FASTQ, bulk RNA-seq และ single-cell RNA-seq ทักษะเฉพาะทางช่วยกำหนดจุดเริ่มต้นของผู้ใช้ ออกแบบการวิเคราะห์เพื่อให้บรรลุผลลัพธ์ทางวิทยาศาสตร์ เชื่อมโยงการออกแบบกับความสามารถที่พร้อมใช้งานของ Nextflow/nf-core หรือ Snakemake รักษาการอนุมัติแบบเนทีฟที่ผูกกับเช็กซัม และตีความผลลัพธ์ที่เสร็จสมบูรณ์จากหลักฐานในไฟล์
คุณทำอะไรได้อีกบ้าง
ตรวจสอบคุณภาพการซีเควนซิง
NGS Analysis Workbench ตรวจสอบข้อมูลซีเควนซิงเหล่านี้และอธิบายเป้าหมายการวิเคราะห์ให้ชัดเจน เลือกเวิร์กโฟลว์ QC ที่รองรับ ตรวจสอบสิ่งที่ต้องมีก่อนเริ่ม และตีความรายงานที่เสร็จแล้วโดยอ้างอิงอาร์ติแฟกต์ที่บันทึกไว้
วางแผนการวิเคราะห์ RNA-seq
NGS Analysis Workbench ตรวจสอบข้อมูลนำเข้าและการออกแบบของงานวิจัย bulk RNA-seq นี้ แนะนำเวิร์กโฟลว์การวิเคราะห์ที่รองรับ ระบุเมทาดาทาที่ยังขาด และอธิบายสิ่งที่ต้องตรวจสอบก่อนดำเนินการ
ตีความผลลัพธ์การซีเควนซิง
NGS Analysis Workbench ตรวจสอบผลลัพธ์การวิเคราะห์ซีเควนซิงที่เสร็จสมบูรณ์เหล่านี้ สรุปปัญหาด้านคุณภาพและผลลัพธ์ แยกข้อค้นพบออกจากข้อสันนิษฐาน และอ้างอิงไฟล์หลักฐาน
สิ่งที่รวมอยู่ในแพ็กเกจ
ทักษะ
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
แหล่งข้อมูล
เพิ่มปลั๊กอิน NGS Analysis Workbench ได้ในไม่กี่คลิก
ความพร้อมใช้งานขึ้นอยู่กับปลั๊กอิน แพ็กเกจของคุณ และการตั้งค่าเวิร์กสเปซ การเชื่อมต่อบางรายการต้องให้ผู้ดูแลระบบตั้งค่าหรืออนุมัติ ติดต่อผู้ดูแลเวิร์กสเปซของคุณหากการเข้าถึงถูกบล็อก
สำรวจปลั๊กอินที่เกี่ยวข้อง
Data
เปลี่ยนข้อมูลให้เป็นการตัดสินใจที่ชัดเจน
Life Sciences Literature
ค้นหาบทความชีวการแพทย์ ฉบับก่อนตีพิมพ์ และฉบับเต็มแบบเปิด
Life Sciences NGS Analysis
การกำหนดเส้นทาง NGS แบบมีคำแนะนำและการประมวลผลในเครื่องสำหรับการวิเคราะห์ลำดับเบส
BioRender
ค้นหาและสร้างภาพประกอบ
Documents
สร้างและแก้ไขเอกสาร
Zotero
ค้นหาบทความวิจัยและเพิ่มการอ้างอิงจาก Zotero
