Life Sciences NGS Analysis
การกำหนดเส้นทาง NGS แบบมีคำแนะนำและการประมวลผลในเครื่องสำหรับการวิเคราะห์ลำดับเบส
- ความสามารถ
- Interactive, Read, Write
- ประเภท
- การศึกษา
- นักพัฒนา
- OpenAI
- เว็บไซต์
- (เปิดในหน้าต่างใหม่)
วิธีการทำงาน
ปลั๊กอินที่ช่วยแนะนำการรับข้อมูล การกำหนดเส้นทาง และการดำเนินงานสำหรับเวิร์กโฟลว์การหาลำดับเบสยุคใหม่ ช่วยให้ Codex ตรวจสอบอินพุตการหาลำดับเบสในเครื่อง ถามเฉพาะข้อมูลที่ขาดไปสำหรับการทดสอบแต่ละประเภท เลือกแพ็กเกจสาธารณะหรือแพ็กเกจที่เข้าถึงได้ฟรีและติดตั้งขณะรันไทม์ได้เมื่อเป็นไปได้ ตรวจสอบว่ามีเครื่องมืออยู่แล้วหรือไม่ก่อนติดตั้ง และเรียกใช้เวิร์กโฟลว์ในเครื่องที่รองรับ พร้อมการตรวจสอบความถูกต้อง บันทึกการทำงาน ไฟล์ manifest รายงาน QC และดัชนีอาร์ติแฟกต์ มาพร้อมความสามารถเชิงลึกเพื่อช่วยตัดสินใจเกี่ยวกับการแยกตัวอย่าง BCL, การดำเนินการและตีความ QC ของ FASTQ, การตรวจหาตัวแปร DNA แบบ germline, somatic และแผง UMI, การสร้างจำนวนอ่านและการวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกันของ bulk RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag รวมถึง QC หลังการนับของ scRNA-seq ที่ผสานไว้ในระบบ
คุณทำอะไรได้อีกบ้าง
ตรวจสอบคุณภาพการหาลำดับเบส
การวิเคราะห์ NGS ด้านวิทยาศาสตร์ชีวภาพ ตรวจสอบอินพุตการหาลำดับเบสเหล่านี้และชี้แจงเป้าหมายการวิเคราะห์ เลือกเวิร์กโฟลว์ QC ที่รองรับ ตรวจสอบสิ่งที่ต้องมีก่อน และตีความรายงานที่เสร็จสมบูรณ์พร้อมอาร์ติแฟกต์ที่บันทึกไว้
วางแผนการวิเคราะห์การหาลำดับเบส RNA
การวิเคราะห์ NGS ด้านวิทยาศาสตร์ชีวภาพ ตรวจสอบอินพุตและการออกแบบของงานวิจัย bulk RNA-seq นี้ แนะนำเวิร์กโฟลว์การวิเคราะห์ที่รองรับ ระบุข้อมูลเมตาที่ยังขาด และอธิบายสิ่งที่ต้องตรวจสอบก่อนดำเนินการ
ตีความผลการหาลำดับเบส
การวิเคราะห์ NGS ด้านวิทยาศาสตร์ชีวภาพ ตรวจสอบผลลัพธ์จากการวิเคราะห์ลำดับเบสที่เสร็จสมบูรณ์เหล่านี้ สรุปปัญหาด้านคุณภาพและผลลัพธ์ แยกข้อค้นพบออกจากข้อสันนิษฐาน และอ้างอิงไฟล์หลักฐานประกอบ
สิ่งที่รวมอยู่ในแพ็กเกจ
ทักษะ
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 เพิ่มเติม
แหล่งข้อมูล
เพิ่มปลั๊กอิน Life Sciences NGS Analysis ได้ในไม่กี่คลิก
ความพร้อมใช้งานขึ้นอยู่กับปลั๊กอิน แพ็กเกจของคุณ และการตั้งค่าเวิร์กสเปซ การเชื่อมต่อบางรายการต้องให้ผู้ดูแลระบบตั้งค่าหรืออนุมัติ ติดต่อผู้ดูแลเวิร์กสเปซของคุณหากการเข้าถึงถูกบล็อก
