NGS Analysis Workbench
Analizirajte podatke sekvenciranja
- Zmožnosti
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Podatki
- Razvijalec
- OpenAI
- Spletna stran
- (odpre se v novem oknu)
Kako deluje
Delovno okolje za NGS, ki vas vodi skozi preverjanje kakovosti FASTQ, RNA-seq na ravni celične populacije in RNA-seq posameznih celic. Specializirane veščine določijo uporabnikovo izhodišče, zasnujejo analizo glede na znanstveni cilj, povežejo zasnovo z razpoložljivimi zmožnostmi orodij Nextflow/nf-core ali Snakemake, ohranijo izvorno odobritev, vezano na kontrolno vsoto, in razložijo končne rezultate na podlagi dokazov v datotekah.
Kaj še lahko počnete?
Preverite kakovost sekvenciranja
NGS Analysis Workbench Preglej te vhodne podatke sekvenciranja in razjasni cilj analize. Izberi podprt potek preverjanja kakovosti, preveri predpogoje in razloži končna poročila s pomočjo shranjenih artefaktov.
Načrtujte analizo sekvenciranja RNA
NGS Analysis Workbench Preglej vhodne podatke in zasnovo te raziskave RNA-seq na ravni celične populacije. Priporoči podprt potek analize, ugotovi, kateri metapodatki manjkajo, in pojasni potrebna preverjanja pred izvedbo.
Razložite rezultate sekvenciranja
NGS Analysis Workbench Preglej te končne rezultate analize podatkov sekvenciranja. Povzemi težave s kakovostjo in rezultate, loči ugotovitve od predpostavk ter navedi datoteke, ki jih podpirajo.
Kaj je vključeno
Veščin
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Sredstva
Dodajte dodatek NGS Analysis Workbench z nekaj kliki
Razpoložljivost je odvisna od dodatka, vašega paketa in nastavitev delovnega prostora. Za nekatere povezave je potrebna nastavitev ali odobritev skrbnika. Če je dostop blokiran, se obrnite na skrbnika delovnega prostora.
Raziščite sorodne dodatke
Data
Pretvorite podatke v jasne odločitve.
Life Sciences Literature
Poiščite biomedicinske članke, prednatise in odprto dostopna celotna besedila
Life Sciences NGS Analysis
Vodeno usmerjanje NGS in lokalno izvajanje analiz sekvenciranja
BioRender
Poiščite in ustvarite slike
Documents
Ustvarjajte in urejajte dokumente
Zotero
Poiščite članke in dodajte navedbe virov iz knjižnice Zotero
