Life Sciences NGS Analysis
Vodeno usmerjanje NGS in lokalno izvajanje analiz sekvenciranja
- Zmožnosti
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Izobraževanje
- Razvijalec
- OpenAI
- Spletna stran
- (odpre se v novem oknu)
Kako deluje
Vodeni dodatek za sprejem zahtev, usmerjanje in izvajanje potekov dela sekvenciranja naslednje generacije. Codexu pomaga pregledati lokalne vhodne podatke sekvenciranja, zastaviti le manjkajoča vprašanja, specifična za preiskavo, po možnosti izbrati javne ali prosto dostopne pakete, ki jih je mogoče namestiti med izvajanjem, pred namestitvijo preveriti razpoložljivost obstoječih orodij ter izvesti podprte lokalne poteke dela s preverjanjem veljavnosti, dnevniki, manifesti, poročili QC in kazali artefaktov. Vključuje napredne zmožnosti odločanja za demultipleksiranje BCL, izvajanje in razlago kontrole kakovosti FASTQ, različice zarodne linije, somatske različice in različice DNK pri panelih UMI, ustvarjanje števnih podatkov ter diferencialno izražanje pri bulk RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag in vgrajeno kontrolo kakovosti scRNA-seq po štetju.
Kaj še lahko počnete?
Pregled kakovosti sekvenciranja
Analiza NGS v vedah o življenju: preglej te vhodne podatke sekvenciranja in pojasni cilj analize. Izberi podprt potek dela QC, preveri predpogoje ter razloži končna poročila in shranjene artefakte.
Načrtovanje analize sekvenciranja RNA
Analiza NGS v vedah o življenju: preglej vhode in zasnovo te študije bulk RNA-seq. Priporoči podprt potek analize, prepoznaj manjkajoče metapodatke in pojasni preverjanja, potrebna pred izvedbo.
Razlaga rezultatov sekvenciranja
Analiza NGS v vedah o življenju: preglej te končne rezultate analize sekvenciranja. Povzemi težave s kakovostjo in rezultate, loči ugotovitve od predpostavk ter navedi podporne datoteke.
Kaj je vključeno
Veščin
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- Še 10
Sredstva
Dodajte dodatek Life Sciences NGS Analysis z nekaj kliki
Razpoložljivost je odvisna od dodatka, vašega paketa in nastavitev delovnega prostora. Za nekatere povezave je potrebna nastavitev ali odobritev skrbnika. Če je dostop blokiran, se obrnite na skrbnika delovnega prostora.
Raziščite sorodne dodatke
Data
Pretvorite podatke v jasne odločitve.
Life Sciences Literature
Poiščite biomedicinske članke, prednatise in odprto dostopna celotna besedila
NGS Analysis Workbench
Analizirajte podatke sekvenciranja
BioRender
Poiščite in ustvarite slike
Documents
Ustvarjajte in urejajte dokumente
Zotero
Poiščite članke in dodajte navedbe virov iz knjižnice Zotero
