NGS Analysis Workbench
Analisar dados de sequenciação
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Como funciona
Um ambiente de trabalho NGS que acompanha todo o percurso de análise, com controlo de qualidade de FASTQ, RNA-seq em massa e RNA-seq de célula única. Competências específicas identificam o ponto de partida do utilizador, planeiam a análise em função de um objetivo científico, associam esse plano às funcionalidades disponíveis do Nextflow/nf-core ou Snakemake, preservam a aprovação nativa vinculada a uma soma de verificação e interpretam os resultados finais com base em evidências documentadas em ficheiros.
O que mais podes fazer?
Avaliar a qualidade da sequenciação
NGS Analysis Workbench Inspeciona estes dados de sequenciação e esclarece o objetivo da análise. Escolhe um fluxo de controlo de qualidade compatível, verifica os pré-requisitos e interpreta os relatórios finais com base nos artefactos guardados.
Planear a análise de sequenciação de RNA
NGS Analysis Workbench Revê os dados de entrada e o desenho deste estudo de RNA-seq em massa. Recomenda um fluxo de análise compatível, identifica os metadados em falta e explica as verificações necessárias antes da execução.
Interpretar os resultados da sequenciação
NGS Analysis Workbench Revê estes resultados finais da análise de sequenciação. Resume os problemas de qualidade e os resultados, distingue as conclusões dos pressupostos e indica os ficheiros que os sustentam.
O que está incluído
Competências
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Recursos
Adiciona o plugin NGS Analysis Workbench em poucos cliques
A disponibilidade depende do plugin, do seu plano e das definições do espaço de trabalho. Algumas ligações requerem configuração ou aprovação do administrador. Contacte o administrador do seu espaço de trabalho se o acesso estiver bloqueado.
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