Life Sciences NGS Analysis
Għażla ggwidata tal-fluss NGS u eżekuzzjoni lokali għall-analiżi tas-sekwenzjar
- Kapaċitajiet
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Edukazzjoni
- Żviluppatur
- OpenAI
- Websajt
- (jinfetaħ f’tieqa ġdida)
Kif jaħdem
Plugin iggwidat għall-ġbir tal-informazzjoni, l-għażla tar-rotta u l-eżekuzzjoni ta’ flussi tax-xogħol tas-sekwenzjar tal-ġenerazzjoni li jmiss. Dan jgħin lil Codex jeżamina l-inputs lokali tas-sekwenzjar, jistaqsi biss il-mistoqsijiet nieqsa speċifiċi għall-assaġġ, jagħżel fejn possibbli pakketti pubbliċi jew aċċessibbli mingħajr ħlas li jistgħu jiġu installati waqt it-tħaddim, jiċċekkja d-disponibbiltà tal-għodod eżistenti qabel kull installazzjoni, u jeżegwixxi flussi tax-xogħol lokali appoġġjati b’validazzjoni, logs, manifesti, rapporti tal-QC u indiċijiet tal-artefatti. Jinkludi kapaċitajiet avvanzati għat-teħid ta’ deċiżjonijiet dwar id-demultipleksjar BCL, l-eżekuzzjoni u l-interpretazzjoni tal-QC tal-FASTQ, il-varjanti tad-DNA ġerminali, somatiċi u tal-pannelli UMI, il-ġenerazzjoni tal-għadd u l-espressjoni differenzjali tal-bulk RNA-seq, l-ATAC-seq, iċ-ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag, u l-QC integrat tal-iscRNA-seq wara l-għadd.
X’tista’ tagħmel aktar?
Irrevedi l-kwalità tas-sekwenzjar
Analiżi NGS tax-Xjenzi tal-Ħajja: eżamina dawn l-inputs tas-sekwenzjar u ċċara l-għan tal-analiżi. Agħżel fluss tax-xogħol tal-QC appoġġjat, iċċekkja l-prerekwiżiti, u interpreta r-rapporti lesti flimkien mal-artefatti ssejvjati.
Ippjana l-analiżi tas-sekwenzjar tal-RNA
Analiżi NGS tax-Xjenzi tal-Ħajja: irrevedi l-inputs u d-disinn ta’ dan l-istudju tal-bulk RNA-seq. Irrakkomanda fluss ta’ analiżi appoġġjat, identifika l-metadata nieqsa, u spjega l-kontrolli meħtieġa qabel l-eżekuzzjoni.
Interpreta r-riżultati tas-sekwenzjar
Analiżi NGS tax-Xjenzi tal-Ħajja: irrevedi dawn l-outputs lesti tal-analiżi tas-sekwenzjar. Agħti sommarju tal-kwistjonijiet tal-kwalità u tar-riżultati, iddistingwi s-sejbiet mis-suppożizzjonijiet, u rreferi għall-fajls ta’ appoġġ.
X’inhu inkluż
Ħiliet
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 aktar
Riżorsi
Żid il-plugin Life Sciences NGS Analysis fi ftit klikks
Id-disponibbiltà tiddependi fuq il-plugin, il-pjan tiegħek u s-settings tal-workspace. Xi konnessjonijiet jeħtieġu konfigurazzjoni jew approvazzjoni mill-amministratur. Ikkuntattja lill-amministratur tal-workspace tiegħek jekk l-aċċess ikun imblukkat.
