NGS Analysis Workbench
Analysez des données de séquençage
- Capacités
- Interactive, Read, Write
- Catégorie
- Données
- Développeur
- OpenAI
Comment ça marche
Un atelier NGS structuré par parcours pour le contrôle qualité FASTQ, le RNA-seq en vrac et le RNA-seq unicellulaire. Des compétences ciblées définissent le point de départ de l’utilisateur, conçoivent une analyse visant un résultat scientifique, la relient aux capacités disponibles de Nextflow/nf-core ou de Snakemake, préservent l’approbation native liée à une somme de contrôle et interprètent les résultats obtenus à partir de preuves issues de fichiers.
Que pouvez-vous faire d'autre ?
Évaluer la qualité du séquençage
NGS Analysis Workbench Examinez ces données de séquençage et précisez l’objectif de l’analyse. Choisissez un workflow de contrôle qualité pris en charge, vérifiez les prérequis et interprétez les rapports finaux à l’aide des artefacts enregistrés.
Planifier une analyse de séquençage ARN
NGS Analysis Workbench Examinez les données d’entrée et le plan de cette étude RNA-seq en vrac. Recommandez un workflow d’analyse pris en charge, identifiez les métadonnées manquantes et expliquez les vérifications nécessaires avant l’exécution.
Interpréter les résultats du séquençage
NGS Analysis Workbench Examinez les résultats de cette analyse de séquençage terminée. Résumez les problèmes de qualité et les résultats, distinguez les observations des hypothèses et citez les fichiers justificatifs.
Qu'est-ce qui est inclus ?
Compétences
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Ressources
Ajoutez le plugin NGS Analysis Workbench en seulement quelques clics
La disponibilité dépend du plugin, de votre forfait et des paramètres de votre espace de travail. Certaines connexions nécessitent une configuration ou une validation par l'administrateur. Contactez l'administrateur de votre espace de travail si l'accès est bloqué.
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