運作方式
一款為次世代定序工作流程提供引導式需求蒐集、分流與執行的外掛程式。它可協助 Codex 檢查本機定序輸入資料、僅詢問缺少的實驗專屬資訊、盡可能選用公開或可免費存取且能在執行環境安裝的套件、安裝前確認現有工具是否可用，並執行支援的本機工作流程，同時產生驗證結果、記錄、資訊清單、QC 報告與產出項目索引。它也具備更深入的決策能力，涵蓋 BCL 拆分、FASTQ QC 執行與判讀、生殖系、體細胞及 UMI panel DNA 變異分析、bulk RNA-seq 計數生成與差異表現分析、ATAC-seq、ChIP-seq／CUT&RUN／CUT&Tag，以及內建的計數後 scRNA-seq QC。
你還能做些什麼？
檢視定序品質
生命科學 NGS 分析：檢查這些定序輸入資料並釐清分析目標。選擇支援的 QC 工作流程、檢查必要條件，並根據已儲存的產出項目解讀完成的報告。
規劃 RNA 定序分析
生命科學 NGS 分析：檢視這項 bulk RNA-seq 研究的輸入資料與設計。建議支援的分析工作流程、找出缺少的中繼資料，並說明執行前所需的檢查。
解讀定序結果
生命科學 NGS 分析：檢視這些已完成的定序分析輸出。摘要說明品質問題與結果、區分研究發現與假設，並引用佐證檔案。
方案內容
技能
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 更多
資源
只需點擊幾下即可新增 Life Sciences NGS Analysis 外掛程式
可用性取決於特定外掛程式、你的訂閱方案及工作區設定。部分連線需要管理員進行設定或批准。若存取權限遭封鎖，請聯絡你的工作區管理員。
