工作原理
一款面向下一代测序工作流的引导式需求收集、流程分派与执行插件。它可帮助 Codex 检查本地测序输入，仅询问缺失的实验类型特定信息，尽可能选择公开或可免费获取且能在运行时安装的软件包，在安装前检查现有工具是否可用，并执行受支持的本地工作流，同时提供验证、日志、清单、质控报告和产物索引。它还具备更深入的决策能力，涵盖 BCL 拆分、FASTQ 质控执行与解读、生殖系变异、体细胞变异和基于 UMI panel 的 DNA 变异、批量 RNA-seq 计数生成与差异表达分析、ATAC-seq、ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag，以及内置的计数后 scRNA-seq 质控。
你还能做什么？
审查测序质量
生命科学 NGS 分析：检查这些测序输入并明确分析目标。选择受支持的质控工作流，检查前提条件，并解读已完成的报告和保存的产物。
规划 RNA 测序分析
生命科学 NGS 分析：审查这项批量 RNA-seq 研究的输入和设计。推荐受支持的分析工作流，找出缺失的元数据，并说明执行前所需的检查。
解读测序结果
生命科学 NGS 分析：审查这些已完成的测序分析输出。总结质量问题和结果，区分实际发现与假设，并引用支持文件。
包含内容
技能
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 更多
资源
只需点击几下即可添加 Life Sciences NGS Analysis 插件
是否可用取决于插件、您的套餐和工作空间设置。某些连接需要管理员进行设置或批准。如果访问受阻，请联系您的工作空间管理员。
