NGS Analysis Workbench
Phân tích dữ liệu giải trình tự
- Năng lực
- Interactive, Read, Write
- Danh mục
- Dữ liệu
- Nhà phát triển
- OpenAI
- Trang web
- (mở trong cửa sổ mới)
Cách thức hoạt động
Bàn làm việc NGS theo quy trình từng bước dành cho QC FASTQ, RNA-seq hàng loạt và RNA-seq đơn bào. Các kỹ năng chuyên biệt xác định điểm xuất phát của người dùng, thiết kế hướng đến kết quả khoa học, kết nối thiết kế đó với các chức năng Nextflow/nf-core hoặc Snakemake đang hoạt động, duy trì quy trình phê duyệt nguyên bản gắn với checksum và diễn giải kết quả hoàn tất dựa trên bằng chứng từ tệp.
Bạn còn có thể làm gì khác?
Đánh giá chất lượng giải trình tự
NGS Analysis Workbench Hãy kiểm tra các dữ liệu giải trình tự đầu vào này và làm rõ mục tiêu phân tích. Chọn quy trình QC được hỗ trợ, kiểm tra điều kiện tiên quyết và diễn giải các báo cáo hoàn tất cùng những tệp kết quả đã lưu.
Lập kế hoạch phân tích RNA-seq
NGS Analysis Workbench Hãy xem xét dữ liệu đầu vào và thiết kế của nghiên cứu RNA-seq hàng loạt này. Đề xuất quy trình phân tích được hỗ trợ, xác định siêu dữ liệu còn thiếu và giải thích các bước kiểm tra cần thiết trước khi chạy.
Diễn giải kết quả giải trình tự
NGS Analysis Workbench Hãy xem xét các kết quả đầu ra đã hoàn tất của quá trình phân tích dữ liệu giải trình tự này. Tóm tắt vấn đề chất lượng và kết quả, phân biệt phát hiện với giả định, đồng thời dẫn chiếu các tệp bằng chứng.
Gồm có những gì
Kỹ năng
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Tài nguyên
Thêm tiện ích NGS Analysis Workbench chỉ với vài cú nhấp chuột
Khả năng cung cấp phụ thuộc vào tiện ích, gói của bạn và cài đặt không gian làm việc. Một số kết nối yêu cầu quản trị viên thiết lập hoặc phê duyệt. Hãy liên hệ với quản trị viên không gian làm việc của bạn nếu quyền truy cập bị chặn.
Khám phá các tiện ích liên quan
Data
Biến dữ liệu thành quyết định rõ ràng.
Life Sciences Literature
Tìm bài báo y sinh, bản tiền xuất bản và toàn văn truy cập mở
Life Sciences NGS Analysis
Hướng dẫn định tuyến NGS và thực thi cục bộ cho phân tích giải trình tự
BioRender
Tìm và tạo hình minh họa
Documents
Tạo và chỉnh sửa tài liệu
Zotero
Tìm bài nghiên cứu và thêm trích dẫn từ Zotero
