Life Sciences NGS Analysis
Hướng dẫn định tuyến NGS và thực thi cục bộ cho phân tích giải trình tự
- Năng lực
- Interactive, Read, Write
- Danh mục
- Giáo dục
- Nhà phát triển
- OpenAI
- Trang web
- (mở trong cửa sổ mới)
Cách thức hoạt động
Tiện ích hướng dẫn tiếp nhận, định tuyến và thực thi quy trình giải trình tự thế hệ mới. Tiện ích giúp Codex kiểm tra dữ liệu giải trình tự cục bộ, chỉ hỏi những thông tin còn thiếu theo từng loại xét nghiệm, ưu tiên chọn các gói công khai hoặc miễn phí có thể cài đặt khi chạy, kiểm tra công cụ hiện có trước khi cài đặt và thực thi các quy trình cục bộ được hỗ trợ kèm xác thực, nhật ký, tệp kê khai, báo cáo QC và chỉ mục sản phẩm. Tiện ích có khả năng ra quyết định chuyên sâu cho việc tách mẫu BCL, thực thi và diễn giải QC FASTQ, xác định biến thể DNA dòng mầm, soma và panel UMI, tạo số đếm và phân tích biểu hiện khác biệt cho RNA-seq số lượng lớn, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag, cùng QC scRNA-seq tích hợp sau bước đếm.
Bạn còn có thể làm gì khác?
Đánh giá chất lượng giải trình tự
Phân tích NGS trong khoa học sự sống: Kiểm tra dữ liệu giải trình tự này và làm rõ mục tiêu phân tích. Chọn quy trình QC được hỗ trợ, kiểm tra điều kiện tiên quyết và diễn giải các báo cáo đã hoàn tất cùng sản phẩm được lưu.
Lập kế hoạch phân tích giải trình tự RNA
Phân tích NGS trong khoa học sự sống: Xem xét dữ liệu đầu vào và thiết kế của nghiên cứu RNA-seq số lượng lớn này. Đề xuất quy trình phân tích được hỗ trợ, xác định siêu dữ liệu còn thiếu và giải thích các bước kiểm tra cần thiết trước khi thực thi.
Diễn giải kết quả giải trình tự
Phân tích NGS trong khoa học sự sống: Xem xét các kết quả phân tích giải trình tự đã hoàn tất này. Tóm tắt các vấn đề chất lượng và kết quả, phân biệt phát hiện với giả định, đồng thời dẫn chiếu các tệp hỗ trợ.
Gồm có những gì
Kỹ năng
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 thêm
Tài nguyên
Thêm tiện ích Life Sciences NGS Analysis chỉ với vài cú nhấp chuột
Khả năng cung cấp phụ thuộc vào tiện ích, gói của bạn và cài đặt không gian làm việc. Một số kết nối yêu cầu quản trị viên thiết lập hoặc phê duyệt. Hãy liên hệ với quản trị viên không gian làm việc của bạn nếu quyền truy cập bị chặn.
