NGS Analysis Workbench
Analysera sekvenseringsdata
- Kapacitet
- Interactive, Read, Write
- Kategori
- Data
- Utvecklare
- OpenAI
- Webbplats
- (öppnas i ett nytt fönster)
Så här fungerar det
En processinriktad NGS-arbetsbänk för kvalitetskontroll av FASTQ, bulk-RNA-seq och encells-RNA-seq. Fokuserade funktioner fastställer användarens utgångspunkt, utformar analysen mot ett vetenskapligt resultat, kopplar den till aktuella funktioner i Nextflow/nf-core eller Snakemake, bevarar inbyggt godkännande knutet till kontrollsumman och tolkar slutförda resultat utifrån filbaserade belägg.
Vad mer kan du göra?
Granska sekvenseringskvalitet
NGS Analysis Workbench Granska dessa sekvenseringsdata och klargör analysmålet. Välj ett kompatibelt arbetsflöde för kvalitetskontroll, kontrollera förutsättningarna och tolka de färdiga rapporterna med hjälp av sparade artefakter.
Planera RNA-sekvenseringsanalys
NGS Analysis Workbench Granska indata och upplägg för den här bulk-RNA-seq-studien. Rekommendera ett kompatibelt arbetsflöde, identifiera metadata som saknas och förklara vilka kontroller som krävs före körning.
Tolka sekvenseringsresultat
NGS Analysis Workbench Granska resultaten från dessa slutförda sekvenseringsanalyser. Sammanfatta kvalitetsproblem och resultat, skilj belagda slutsatser från antaganden och hänvisa till stödfilerna.
Vad som ingår
Färdigheter
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Resurser
Lägg till pluginet NGS Analysis Workbench med några få klick
Tillgängligheten beror på pluginet, ditt abonnemang och inställningarna för arbetsytan. Vissa anslutningar kräver konfiguration eller godkännande av administratören. Kontakta administratören för din arbetsyta om åtkomsten blockeras.
Utforska relaterade plugins
Data
Omvandla data till tydliga beslut.
Life Sciences Literature
Hitta biomedicinska artiklar, preprintartiklar och öppet tillgänglig fulltext
Life Sciences NGS Analysis
Vägledd dirigering och lokal körning av NGS-baserad sekvenseringsanalys
BioRender
Hitta och skapa figurer
Documents
Skapa och redigera dokument
Zotero
Hitta artiklar och lägg till källhänvisningar från Zotero
