NGS Analysis Workbench
Analyser sekvenseringsdata
- Kapabiliteter
- Interactive, Read, Write
- Kategori
- Data
- Utvikler
- OpenAI
- Nettsted
- (åpnes i et nytt vindu)
Slik fungerer det
Et NGS-analyseverktøy som støtter hele prosessen for FASTQ-kvalitetskontroll, bulk-RNA-seq og enkeltcelle-RNA-seq. Spesialiserte ferdigheter kartlegger brukerens utgangspunkt, utformer analysen med sikte på et vitenskapelig resultat, knytter oppsettet til tilgjengelig funksjonalitet i Nextflow/nf-core eller Snakemake, ivaretar innebygd godkjenning knyttet til kontrollsummer og tolker ferdige resultater ut fra dokumentasjon i filer.
Hva annet kan du gjøre?
Vurder sekvenseringskvaliteten
NGS Analysis Workbench Undersøk disse sekvenseringsdataene, og avklar målet med analysen. Velg en støttet arbeidsflyt for kvalitetskontroll, sjekk forutsetningene, og tolk de ferdige rapportene ved hjelp av lagrede analysefiler.
Planlegg analyse av RNA-sekvenseringsdata
NGS Analysis Workbench Gå gjennom inndataene og designet for denne bulk-RNA-seq-studien. Anbefal en støttet arbeidsflyt for analysen, identifiser manglende metadata, og forklar hvilke kontroller som trengs før kjøring.
Tolk sekvenseringsresultater
NGS Analysis Workbench Gå gjennom disse resultatene fra den ferdige sekvenseringsanalysen. Oppsummer kvalitetsproblemer og resultater, skill mellom funn og antakelser, og henvis til filene som underbygger funnene.
Dette er inkludert
Ferdigheter
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Ressurser
Legg til plugin-en NGS Analysis Workbench med noen få klikk
Tilgjengeligheten avhenger av pluginen, abonnementet ditt og innstillingene for arbeidsområdet. Noen tilkoblinger krever oppsett eller godkjenning fra en administrator. Kontakt administratoren for arbeidsområdet hvis tilgangen er blokkert.
Utforsk relaterte pluginer
Data
Gjør data om til tydelige beslutninger.
Life Sciences Literature
Finn biomedisinske artikler, preprint-artikler og fulltekst med åpen tilgang
Life Sciences NGS Analysis
Veiledet NGS-ruting og lokal kjøring av sekvenseringsanalyser
BioRender
Finn og lag figurer
Documents
Opprett og rediger dokumenter
Zotero
Finn artikler og legg til kildehenvisninger fra Zotero
