NGS Analysis Workbench

Analisis data penjujukan

Keupayaan: Interactive, Read, Write
Kategori: Data
Pembangun: OpenAI
Laman web: (dibuka dalam tetingkap baru)

NGS Analysis Workbench jalankan QC FastQC dan Salmon pada set data RNA-seq awam dan berikan tafsiran hasilnya.

Bagaimana ia berfungsi

Ruang kerja NGS yang menyokong setiap peringkat analisis untuk QC FASTQ, RNA-seq pukal dan RNA-seq sel tunggal. Kemahiran khusus mengenal pasti titik permulaan pengguna, merancang analisis untuk mencapai hasil saintifik, memadankan rancangan itu dengan keupayaan Nextflow/nf-core atau Snakemake yang tersedia, mengekalkan kelulusan natif yang terikat pada hasil tambah semak, serta mentafsir hasil analisis yang telah selesai berdasarkan bukti dalam fail.

Apa lagi yang boleh anda lakukan?

Semak kualiti penjujukan
NGS Analysis Workbench Periksa input penjujukan ini dan perjelas matlamat analisis. Pilih aliran kerja QC yang disokong, semak prasyarat dan tafsir laporan yang telah siap menggunakan artifak yang disimpan.
Cuba dalam ChatGPT Work(dibuka dalam tetingkap baru)
Rancang analisis penjujukan RNA
NGS Analysis Workbench Semak input dan reka bentuk kajian RNA-seq pukal ini. Cadangkan aliran kerja analisis yang disokong, kenal pasti metadata yang tiada dan jelaskan semakan yang diperlukan sebelum pelaksanaan.
Cuba dalam ChatGPT Work(dibuka dalam tetingkap baru)
Tafsir hasil penjujukan
NGS Analysis Workbench Semak output analisis penjujukan yang telah selesai ini. Ringkaskan isu kualiti dan hasil analisis, bezakan dapatan daripada andaian dan rujuk fail sokongan.
Cuba dalam ChatGPT Work(dibuka dalam tetingkap baru)

Apakah yang disertakan

Kemahiran

Design NGS Analysis
NGS Analysis Workbench
Run NGS Analysis
Understand NGS Data
Understand NGS Results

Sumber

Tambah pemalam NGS Analysis Workbench dalam beberapa klik

Semak imbas pemalam yang menyokong alat dan tugas pasukan anda.

Direktori pemalam ChatGPT yang memaparkan Google Drive, Slack dan Google Calendar.

Pasang pemalam, kemudian ikuti prom untuk menyemak kebenaran dan menyambungkan mana-mana aplikasi yang diperlukan.

Mulakan sembang baharu dalam ChatGPT Work atau Codex, terangkan hasil yang anda perlukan dan minta ia menggunakan pemalam.

Ketersediaan bergantung pada pemalam, pelan anda dan tetapan ruang kerja. Sesetengah sambungan memerlukan persediaan atau kelulusan pentadbir. Hubungi pentadbir ruang kerja anda jika akses disekat.

Lihat panduan persediaan