Life Sciences NGS Analysis
Penghalaan NGS berpandu dan pelaksanaan setempat untuk analisis penjujukan
- Keupayaan
- Interactive, Read, Write
- Kategori
- Pendidikan
- Pembangun
- OpenAI
- Laman web
- (dibuka dalam tetingkap baru)
Bagaimana ia berfungsi
Pemalam pengambilan berpandu, penghalaan dan pelaksanaan untuk aliran kerja penjujukan generasi seterusnya. Pemalam ini membantu Codex memeriksa input penjujukan setempat, hanya menanyakan maklumat khusus asai yang belum diberikan, memilih pakej awam atau boleh diakses secara percuma yang boleh dipasang semasa masa jalan jika boleh, menyemak ketersediaan alat sedia ada sebelum pemasangan, serta menjalankan aliran kerja setempat yang disokong dengan pengesahan, log, manifes, laporan QC dan indeks artifak. Pemalam ini merangkumi kemahiran membuat keputusan yang lebih mendalam untuk penyahmultipleksan BCL, pelaksanaan dan pentafsiran QC FASTQ, varian DNA germa, somatik dan panel UMI, penjanaan kiraan RNA-seq pukal dan ekspresi pembezaan, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag serta QC scRNA-seq selepas pengiraan yang terbina dalam.
Apa lagi yang boleh anda lakukan?
Semak kualiti penjujukan
Analisis NGS Sains Hayat Periksa input penjujukan ini dan jelaskan matlamat analisis. Pilih aliran kerja QC yang disokong, semak prasyarat dan tafsirkan laporan yang lengkap berserta artifak yang disimpan.
Rancang analisis penjujukan RNA
Analisis NGS Sains Hayat Semak input dan reka bentuk kajian RNA-seq pukal ini. Cadangkan aliran kerja analisis yang disokong, kenal pasti metadata yang tiada dan terangkan semakan yang diperlukan sebelum pelaksanaan.
Tafsirkan hasil penjujukan
Analisis NGS Sains Hayat Semak output analisis penjujukan yang lengkap ini. Ringkaskan isu kualiti dan hasil, bezakan dapatan daripada andaian serta rujuk fail sokongan.
Apakah yang disertakan
Kemahiran
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 lagi
Sumber
Tambah pemalam Life Sciences NGS Analysis dalam beberapa klik
Ketersediaan bergantung pada pemalam, pelan anda dan tetapan ruang kerja. Sesetengah sambungan memerlukan persediaan atau kelulusan pentadbir. Hubungi pentadbir ruang kerja anda jika akses disekat.
