NGS Analysis Workbench
Analizē sekvenēšanas datus
- Spējas
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Dati
- Izstrādātājs
- OpenAI
- Tīmekļa vietne
- (atveras jaunā logā)
Kā tas darbojas
NGS darba vide, kas palīdz visos FASTQ kvalitātes kontroles, šūnu kopuma RNA-seq un atsevišķu šūnu RNA-seq analīzes posmos. Specializētas prasmes nosaka lietotāja sākumpunktu, izstrādā plānu zinātniskā mērķa sasniegšanai un sasaista to ar pieejamajām Nextflow/nf-core vai Snakemake iespējām. Tās saglabā ar kontrolsummu sasaistītu apstiprinājumu pašā sistēmā un interpretē iegūtos rezultātus, balstoties uz failos saglabātajiem pierādījumiem.
Ko vēl tu vari darīt?
Novērtē sekvenēšanas kvalitāti
NGS Analysis Workbench pārbaudi šos sekvenēšanas ievaddatus un precizē analīzes mērķi. Izvēlies atbalstītu kvalitātes kontroles darbplūsmu, pārbaudi priekšnosacījumus un interpretē gatavos pārskatus, izmantojot saglabātos artefaktus.
Plāno RNS sekvenēšanas analīzi
NGS Analysis Workbench pārskati šī šūnu kopuma RNA-seq pētījuma ievaddatus un plānojumu. Iesaki atbalstītu analīzes darbplūsmu, nosaki, kādu metadatu trūkst, un izskaidro pirms izpildes nepieciešamās pārbaudes.
Interpretē sekvenēšanas rezultātus
NGS Analysis Workbench pārskati šos pabeigtās sekvenēšanas analīzes izvaddatus. Apkopo kvalitātes problēmas un rezultātus, nošķir konstatēto no pieņēmumiem un norādi failus, kas pamato secinājumus.
Kas ir iekļauts
Prasmes
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Resursi
Pievieno spraudni NGS Analysis Workbench ar dažiem klikšķiem
Pieejamība ir atkarīga no spraudņa, tava plāna un darbvietas iestatījumiem. Daži savienojumi jāiestata vai jāapstiprina administratoram. Ja piekļuve ir bloķēta, sazinies ar darbvietas administratoru.
Izpēti saistītos spraudņus
Data
Pārvērtiet datus skaidros lēmumos.
Life Sciences Literature
Atrodiet biomedicīnas rakstus, preprintus un atvērtās piekļuves pilntekstus
Life Sciences NGS Analysis
Vadīta NGS darbplūsmas izvēle un lokāla sekvencēšanas analīzes izpilde
BioRender
Atrodiet un veidojiet attēlus
Documents
Veidojiet un rediģējiet dokumentus
Zotero
Atrodi rakstus un pievieno atsauces no Zotero
