Life Sciences NGS Analysis
Vadīta NGS darbplūsmas izvēle un lokāla sekvencēšanas analīzes izpilde
- Spējas
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Izglītība
- Izstrādātājs
- OpenAI
- Tīmekļa vietne
- (atveras jaunā logā)
Kā tas darbojas
Vadītas ievaddatu apkopošanas, maršrutēšanas un izpildes spraudnis nākamās paaudzes sekvencēšanas darbplūsmām. Tas palīdz Codex pārbaudīt lokālos sekvencēšanas ievaddatus, uzdot tikai trūkstošos, konkrētajam testam būtiskos jautājumus, pēc iespējas izvēlēties publiskas vai brīvi pieejamas pakotnes, kuras var instalēt izpildlaikā, pirms instalēšanas pārbaudīt esošo rīku pieejamību un izpildīt atbalstītās lokālās darbplūsmas ar validāciju, žurnāliem, manifestiem, QC pārskatiem un artefaktu indeksiem. Tas ietver padziļinātas lēmumu pieņemšanas prasmes BCL demultipleksēšanai, FASTQ QC izpildei un interpretēšanai, iedzimto, somatisko un UMI paneļu DNS variantu analīzei, kopējās RNA-seq nolasījumu skaita noteikšanai un diferenciālās ekspresijas analīzei, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag, kā arī integrētai scRNA-seq QC pēc nolasījumu skaita noteikšanas.
Ko vēl tu vari darīt?
Pārbaudīt sekvencēšanas kvalitāti
Dzīvības zinātņu NGS analīze. Pārbaudi šos sekvencēšanas ievaddatus un precizē analīzes mērķi. Izvēlies atbalstītu QC darbplūsmu, pārbaudi priekšnosacījumus un interpretē sagatavotos pārskatus un saglabātos artefaktus.
Plānot RNS sekvencēšanas analīzi
Dzīvības zinātņu NGS analīze. Pārskati šī kopējās RNA-seq pētījuma ievaddatus un plānojumu. Iesaki atbalstītu analīzes darbplūsmu, nosaki trūkstošos metadatus un izskaidro pirms izpildes nepieciešamās pārbaudes.
Interpretēt sekvencēšanas rezultātus
Dzīvības zinātņu NGS analīze. Pārskati šos pabeigtās sekvencēšanas analīzes rezultātus. Apkopo kvalitātes problēmas un rezultātus, nošķir konstatējumus no pieņēmumiem un atsaucies uz tos pamatojošajiem failiem.
Kas ir iekļauts
Prasmes
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 vairāk
Resursi
Pievieno spraudni Life Sciences NGS Analysis ar dažiem klikšķiem
Pieejamība ir atkarīga no spraudņa, tava plāna un darbvietas iestatījumiem. Daži savienojumi jāiestata vai jāapstiprina administratoram. Ja piekļuve ir bloķēta, sazinies ar darbvietas administratoru.
Izpēti saistītos spraudņus
Data
Pārvērtiet datus skaidros lēmumos.
Life Sciences Literature
Atrodiet biomedicīnas rakstus, preprintus un atvērtās piekļuves pilntekstus
NGS Analysis Workbench
Analizē sekvenēšanas datus
BioRender
Atrodiet un veidojiet attēlus
Documents
Veidojiet un rediģējiet dokumentus
Zotero
Atrodi rakstus un pievieno atsauces no Zotero
