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작동 방식
차세대 염기서열 분석 워크플로의 요구사항 수집, 경로 설정, 실행을 안내하는 플러그인입니다. Codex가 로컬 염기서열 분석 입력 데이터를 검사하고, 분석법별로 누락된 정보만 질문하며, 가능한 경우 공개 또는 무료로 이용할 수 있고 실행 시 설치 가능한 패키지를 선택하도록 지원합니다. 또한 설치 전에 기존 도구의 가용성을 확인하고, 검증 결과, 로그, 매니페스트, QC 보고서, 산출물 인덱스와 함께 지원되는 로컬 워크플로를 실행합니다. BCL 디멀티플렉싱, FASTQ QC 실행 및 해석, 생식세포·체세포·UMI 패널 DNA 변이, 벌크 RNA-seq 카운트 생성 및 차등 발현 분석, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag, 카운트 후 scRNA-seq QC를 위한 심층 의사 결정 기능도 제공합니다.
그 밖에 어떤 작업을 할 수 있나요?
염기서열 분석 품질 검토
생명과학 NGS 분석: 이 염기서열 분석 입력 데이터를 검사하고 분석 목표를 명확히 하세요. 지원되는 QC 워크플로를 선택하고 필수 조건을 확인한 뒤, 저장된 산출물과 함께 완료된 보고서를 해석하세요.
RNA 염기서열 분석 계획 수립
생명과학 NGS 분석: 이 벌크 RNA-seq 연구의 입력 데이터와 설계를 검토하세요. 지원되는 분석 워크플로를 추천하고, 누락된 메타데이터와 실행 전에 필요한 점검 사항을 설명하세요.
염기서열 분석 결과 해석
생명과학 NGS 분석: 완료된 염기서열 분석 결과물을 검토하세요. 품질 문제와 결과를 요약하고, 확인된 내용과 가정을 구분한 뒤 근거 파일을 제시하세요.
포함된 기능
스킬
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 더 보기
리소스
몇 번의 클릭으로 Life Sciences NGS Analysis 플러그인 추가하기
사용 가능 여부는 플러그인, 플랜 및 워크스페이스 설정에 따라 달라집니다. 일부 연결에는 관리자의 설정 또는 승인이 필요합니다. 액세스가 차단된 경우 워크스페이스 관리자에게 문의하세요.
