NGS Analysis Workbench
Szekvenálási adatok elemzése
- Képességek
- Interactive, Read, Write
- Kategória
- Adatok
- Fejlesztő
- OpenAI
- Honlap
- (új ablakban nyílik meg)
Hogyan működik
A teljes elemzési folyamatot végigkísérő NGS-munkakörnyezet FASTQ-minőségellenőrzéshez, bulk RNA-seq és egysejtes RNA-seq elemzésekhez. Célzott képességek mérik fel a felhasználó kiinduló helyzetét, tudományos célhoz igazítják az elemzési tervet, és összekapcsolják azt az elérhető Nextflow/nf-core vagy Snakemake funkciókkal. Megőrzik az ellenőrző összeghez kötött natív jóváhagyást, és fájlokban rögzített bizonyítékok alapján értelmezik az elkészült eredményeket.
Mire másra vagy még képes?
A szekvenálás minőségének ellenőrzése
NGS Analysis Workbench Vizsgáld meg ezeket a szekvenálási bemeneti adatokat, és tisztázd az elemzés célját. Válassz támogatott minőségellenőrzési munkafolyamatot, ellenőrizd az előfeltételeket, és értelmezd a kész jelentéseket a mentett fájlok alapján.
RNS-szekvenálási elemzés tervezése
NGS Analysis Workbench Tekintsd át a bulk RNA-seq-vizsgálat bemeneti adatait és tervét. Javasolj támogatott elemzési munkafolyamatot, azonosítsd a hiányzó metaadatokat, és ismertesd a futtatás előtt szükséges ellenőrzéseket.
Szekvenálási eredmények értelmezése
NGS Analysis Workbench Tekintsd át ezeket az elkészült szekvenáláselemzési kimeneteket. Foglald össze a minőségi problémákat és az eredményeket, különítsd el a megállapításokat a feltételezésektől, és hivatkozz az ezeket alátámasztó fájlokra.
Mit tartalmaz
Készségek
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Erőforrások
Adja hozzá néhány kattintással a(z) NGS Analysis Workbench beépülő modult
Az elérhetőség a beépülő modultól, a csomagodtól és a munkaterület beállításaitól függ. Egyes kapcsolatok rendszergazdai beállítást vagy jóváhagyást igényelnek. Ha a hozzáférés le van tiltva, fordulj a munkaterület rendszergazdájához.
Kapcsolódó beépülő modulok felfedezése
Data
Az adatok alapján hozzon egyértelmű döntéseket.
Life Sciences Literature
Orvosbiológiai tanulmányok, preprintek és nyílt hozzáférésű teljes szövegek keresése
Life Sciences NGS Analysis
Irányított NGS-folyamatválasztás és helyi futtatás szekvenálási elemzéshez
BioRender
Ábrák keresése és készítése
Documents
Dokumentumok létrehozása és szerkesztése
Zotero
Keress tanulmányokat, és adj hozzá hivatkozásokat a Zoteróból
