Life Sciences NGS Analysis
Irányított NGS-folyamatválasztás és helyi futtatás szekvenálási elemzéshez
- Képességek
- Interactive, Read, Write
- Kategória
- Oktatás
- Fejlesztő
- OpenAI
- Honlap
- (új ablakban nyílik meg)
Hogyan működik
Irányított adatbekérési, munkafolyamat-kiválasztási és végrehajtási beépülő modul új generációs szekvenálási munkafolyamatokhoz. Segít a Codexnek megvizsgálni a helyi szekvenálási bemeneteket, csak a hiányzó, vizsgálattípus-specifikus kérdéseket feltenni, lehetőség szerint nyilvános vagy szabadon hozzáférhető, futás közben telepíthető csomagokat választani, telepítés előtt ellenőrizni a meglévő eszközök elérhetőségét, valamint validálással, naplókkal, jegyzékfájlokkal, QC-jelentésekkel és eredményfájl-jegyzékekkel végrehajtani a támogatott helyi munkafolyamatokat. Fejlett döntéstámogatási képességeket kínál a BCL-demultiplexeléshez, a FASTQ QC végrehajtásához és értelmezéséhez, a csíravonalbeli, szomatikus és UMI-paneles DNS-variánsokhoz, a bulk RNA-seq számlálási adatainak előállításához és differenciális expressziós elemzéséhez, az ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag elemzésekhez, valamint az integrált, számlálás utáni scRNA-seq QC-hez.
Mire másra vagy még képes?
A szekvenálás minőségének ellenőrzése
Élettudományi NGS-elemzés: Vizsgáld meg ezeket a szekvenálási bemeneteket, és tisztázd az elemzés célját. Válassz támogatott QC-munkafolyamatot, ellenőrizd az előfeltételeket, majd értelmezd az elkészült jelentéseket és a mentett eredményfájlokat.
RNS-szekvenálási elemzés megtervezése
Élettudományi NGS-elemzés: Tekintsd át ennek a bulk RNA-seq vizsgálatnak a bemeneteit és felépítését. Javasolj támogatott elemzési munkafolyamatot, azonosítsd a hiányzó metaadatokat, és ismertesd a futtatás előtt szükséges ellenőrzéseket.
A szekvenálási eredmények értelmezése
Élettudományi NGS-elemzés: Tekintsd át az elkészült szekvenálási elemzés kimeneteit. Foglald össze a minőségi problémákat és az eredményeket, különítsd el a megállapításokat a feltételezésektől, és hivatkozz az alátámasztó fájlokra.
Mit tartalmaz
Készségek
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 továbbira
Erőforrások
Adja hozzá néhány kattintással a(z) Life Sciences NGS Analysis beépülő modult
Az elérhetőség a beépülő modultól, a csomagodtól és a munkaterület beállításaitól függ. Egyes kapcsolatok rendszergazdai beállítást vagy jóváhagyást igényelnek. Ha a hozzáférés le van tiltva, fordulj a munkaterület rendszergazdájához.
Kapcsolódó beépülő modulok felfedezése
Data
Az adatok alapján hozzon egyértelmű döntéseket.
Life Sciences Literature
Orvosbiológiai tanulmányok, preprintek és nyílt hozzáférésű teljes szövegek keresése
NGS Analysis Workbench
Szekvenálási adatok elemzése
BioRender
Ábrák keresése és készítése
Documents
Dokumentumok létrehozása és szerkesztése
Zotero
Keress tanulmányokat, és adj hozzá hivatkozásokat a Zoteróból
