एजेंटिक AI के दौर में साइंटिफ़िक कंप्यूटिंग
एक फ़ील्ड रिपोर्ट बताती है कि वैज्ञानिक जीनोमिक्स और अन्य डेटा-आधारित क्षेत्रों के साइंटिफ़िक सॉफ़्टवेयर को आधुनिक बनाने के लिए कोडिंग एजेंटों का इस्तेमाल कैसे कर रहे हैं.
साइंटिफ़िक कंप्यूटिंग आज अकादमिक संस्थानों और इंडस्ट्री, दोनों में आधुनिक रिसर्च का एक अहम आधार है. लेकिन डेटा जितनी तेज़ी से बढ़ रहा है, उसे विज्ञान के नज़रिए से समझने वाला सॉफ़्टवेयर उतनी तेज़ी से काम नहीं कर पाया है. आज इस्तेमाल होने वाले कई रिसर्च टूल्स की शुरुआत किसी रिसर्च पेपर के साथ लिखे गए कोड से हुई थी. इन्हें छोटी-छोटी अकादमिक टीमों ने बनाया था, जिनके पास इंजीनियरिंग का सीमित अनुभव और कोड को पैकेज करने, टेस्ट करने, ऑप्टिमाइज़ करने या लंबे समय तक उसे सपोर्ट देने के लिए कम समय था. इसका नतीजा यह है कि आज भी कई साइंटिफ़िक इंफ़्रास्ट्रक्चर ऐसे धीमे और नाज़ुक वर्कफ़्लोज़ पर निर्भर हैं, जिन्हें लगातार संभालते रहना पड़ता है. यही सीमाएँ नई खोजों की रफ़्तार को धीमा कर देती हैं.
AI एजेंट अब इस स्थिति को बदलने लगे हैं. इंजीनियरिंग के काम का खर्च घटाकर और इम्प्लीमेंटेशन के मुश्किल कामों को अपने ज़िम्मे लेकर, ये रिसर्चरों को नए आइडियाज़ का प्रोटोटाइप जल्दी बनाने, ऐसे प्रोजेक्ट्स पर काम करके, जो पहले व्यवहारिक नहीं लगते थे, और लंबे समय तक सॉफ़्टवेयर की देखभाल करने में मदद करते हैं. इसका नतीजा यह है कि साइंटिफ़िक सॉफ़्टवेयर ज़्यादा असरदार बनता है, उसकी बेहतर देखभाल होती है, जिससे वैज्ञानिक अपना ज़्यादा समय नई खोजों पर लगा पाते हैं.
हम एक शुरुआती फ़ील्ड रिपोर्ट शेयर कर रहे हैं, जिसमें खास तौर पर लाइफ़ साइंसेज़ से जुड़े साइंटिफ़िक कंप्यूटिंग के ऐसे आठ प्रोजेक्ट्स हैं, जिनमें एजेंट की सहायता ली गई है. इनमें से पाँच में सिर्फ़ Codex का इस्तेमाल हुआ, जबकि तीन में Codex और Claude Code दोनों का साथ में इस्तेमाल किया गया. इस रिपोर्ट में हर प्रोजेक्ट की टीम द्वारा लिखी गई केस स्टडीज़ शामिल हैं और उनमें बार-बार दिखाई देने वाली थीम्स भी हैं. इन प्रोजेक्ट्स में नियमित मेंटेनेंस, चुनिंदा ऑप्टिमाइज़ेशन, बड़े स्तर पर लैंग्वेज माइग्रेशन और GPU-नेटिव की री-डिज़ाइन जैसे काम शामिल हैं. इस पर काम करने वाली टीमों के मुताबिक, एजेंट्स ने सॉफ़्टवेयर डेवलपमेंट और मेंटेनेंस की रफ़्तार काफ़ी तेज़ की. कुछ मामलों में छोटी टीमों ने भी ऐसे काम पूरे किए, जिनके लिए पहले कहीं ज़्यादा समय या विशेषज्ञ इंजीनियरिंग सहायता की ज़रूरत पड़ती. साथ ही, उन्होंने यह भी बताया कि इन टूल्स की लंबे समय तक ज़िम्मेदारी और देखभाल तय करना अब भी एक बड़ी चुनौती है.
इसमें शामिल सभी लोगों ने बताया कि रिसर्चरों की भूमिका लगातार बदल रही है. अब उनका ज़्यादा ध्यान खुद इम्प्लीमेंटेशन करने के बजाय उसके वेरिफ़िकेशन और ऑर्केस्ट्रेशन पर है: यानी यह तय करना कि क्या बनाना है, उसके सही से काम करने की जाँच कैसे करनी है, और कब किसी प्रोजेक्ट को रिलीज़ के लिए तैयार करना है. इस नए मॉडल में साइंस के लिहाज़ से रिसर्च की दिशा और क्वालिटी पर रिसर्चर्स का पूरा कंट्रोल रहता है, जबकि एजेंट्स काम की रफ़्तार बढ़ाने में मदद करते हैं.
काफ़ी इस्तेमाल होने वाली लाइब्रेरी को आधुनिक बनाया गया ताकि जीनोमिक डेटा को पार्स किया जा सके
cyvcf2 एक Python लाइब्रेरी है, जिसका इस्तेमाल जीनोमिक वैरिएंट फ़ाइलों को पढ़ने और लिखने के लिए किया जाता है. GPT‑5.5 ने इस लाइब्रेरी के पुराने बिल्ड और पैकेजिंग सिस्टम की जगह एक नया और यूनिफ़ाइड प्रोसेस तैयार किया, जिससे इसे इंस्टॉल करना, टेस्ट करना और नई रिलीज़ जारी करना पहले से कहीं आसान हो गया.
कोडिंग एजेंट्स की मदद से तेज़ी से आगे बढ़ना अब काफ़ी आसान हो गया है. लेकिन फ़िलहाल विज्ञान में दूर तक जाने के लिए विशेषज्ञों की समझ, गहरी जानकारी, सही फ़ैसलों और सावधानी की ज़रूरत अब भी बनी हुई है.
—ब्रेंट पेडरसन
हालाँकि इन प्रोजेक्ट्स का दायरा अलग-अलग था, लेकिन सभी ने यह दिखाया कि कोडिंग एजेंट्स साइंटिफ़िक कंप्यूटिंग में इंजीनियरिंग की मेहनत और विशेषज्ञता पर निर्भरता कम कर रहे हैं. अब सबसे बड़ी चुनौती AI एजेंट के आउटपुट को वैलिडेट करना है, क्योंकि इसके लिए अभी भी इंसानी समझ और फ़ैसले की ज़रूरत होती है.
सभी केस स्टडीज़ में यह देखा गया कि एजेंट्स उन कामों को अच्छे से कर लेते थे, जो साफ़ तौर पर बताए गए हों और जिनमें स्कोप की पूरी जानकारी दी गई हो, लेकिन वे पूरे भरोसे के साथ यह नहीं बता पाते थे कि उनका काम साइंस के लिहाज़ से सही है या उम्मीदों के मुताबिक. कई बार वे साफ़ गलतियों के बावजूद पूरे भरोसे के साथ जवाब देते थे. इसलिए इंसानी रिव्यूअर्स को नतीजे वैलिडेट करने के भरोसेमंद तरीके अपनाने पड़े. सबसे असरदार तरीका यह रहा कि किसी बाहरी रेफ़रेंस या साफ़-साफ़ तय किए गए नतीजों से तुलना की जाए, जैसे आउटपुट का पूरी तरह मेल खाना, किसी मौजूदा टूल के बराबर नतीजे देना, आँकड़ों के लिहाज़ से सही व्यवहार करना, या सिम्युलेटेड डेटा के आधार पर पहले से तय जवाबों से मेल खाना.
एक और बात लगभग हर प्रोजेक्ट में बार-बार देखने को मिली. काम एक ही बार में पूरा नहीं हुआ, बल्कि लगातार फ़ीडबैक लेकर छोटे-छोटे चरणों में आगे बढ़ा. टीमों ने बड़े लक्ष्यों को छोटे-छोटे हिस्सों में बाँटा और बीच-बीच में बेंचमार्क्स और टेस्ट सिस्टम्स की मदद से एजेंट्स के काम की जाँच की और उनमें सुधार किया. एजेंट्स शुरुआती इम्प्लीमेंटेशन जल्दी तैयार कर देते थे, लेकिन मुश्किल मामलों और आँकड़ों के बारीक फ़र्क को ठीक करने में काफ़ी ज़्यादा समय लगता था. यानी किसी इम्प्लीमेंटेशन का आखिरी हिस्सा पूरा करने में सबसे ज़्यादा मेहनत लगती थी.
कुल मिलाकर, ये केस स्टडीज़ दिखाती हैं कि एजेंट्स की मदद से वैज्ञानिक अब इम्प्लीमेंटेशन पर कम और असली साइंटिफ़िक कामों को दिशा देने पर ज़्यादा समय दे पा रहे हैं. लोग लक्ष्य तय करते हैं, बड़े प्रोजेक्ट्स को छोटे और संभाले जा सकने वाले हिस्सों में बाँटते हैं और यह तय करते हैं कि नतीजे साइंटिफ़िक तौर पर सही हैं या नहीं. लंबे समय से चली आ रही इंजीनियरिंग की सीमाओं को कम करके, एजेंट्स रिसर्चर्स को पहले से कहीं ज़्यादा बिल्ड करने की आज़ादी देते हैं, ताकि वे उन साइंटिफ़िक सवालों और फ़ैसलों पर ध्यान दे सकें जो सबसे ज़्यादा मायने रखते हैं.
रिसर्च सॉफ़्टवेयर की देखभाल में कमी की वजह से नए बदलावों की रफ़्तार बहुत समय से धीमी रही है और नतीजों को दोबारा हासिल करना और उन पर भरोसा करना भी मुश्किल हुआ है. "रिसर्च कोड(एक नई विंडो में खुलेगा)" और ओमिक्स टूल्स(एक नई विंडो में खुलेगा) पर पब्लिश की गई स्टडीज़ में पाया गया है कि कई बार पब्लिश किए गए सॉफ़्टवेयर नए कंप्यूटिंग सेटअप पर सही तरह से इंस्टॉल नहीं होते या बताए गए तरीके से चलते ही नहीं हैं. इस वजह से रिसर्चर्स का काफ़ी समय कॉन्फ़िगरेशन और डिबगिंग में चला जाता है. वहीं, नियमित किए जाने वाले सुधार भी रिसर्चर्स का समय बचा सकते हैं और कंप्यूटिंग की माँग कम कर सकते हैं. परफ़ॉर्मेंस बेहतर बनाने के लिए किए गए रीफ़ैक्टरिंग और कोड को फिर से लिखने (री-राइट्स) से इससे भी बड़े फ़ायदे हो सकते हैं.
लेकिन जब इम्प्लीमेंटेशन की लागत कम हो जाती है, तो एक जैसे कई री-राइट्स बनाना भी आसान हो जाता है. इससे यूज़र्स अलग-अलग टूल्स में बँट जाते हैं और किसी एक टूल को भरोसेमंद बनाए रखने के लिए ज़रूरी विशेषज्ञों का ध्यान भी बिखर जाता है. इसलिए लंबे समय तक ज़िम्मेदारी लेना और सही श्रेय देना बहुत ज़रूरी है. समय के साथ विकसित हुए साइंटिफ़िक सॉफ़्टवेयर में कई ऐसे नियम, कम्पैटिबिलिटी की ज़रूरतें और यूज़र का भरोसा शामिल होता है, जो सिर्फ़ सोर्स कोड के ट्रांसलेशन से दोबारा नहीं बनाया जा सकता.
इन केस स्टडीज़ से आगे बढ़ने के कई रास्ते सामने आते हैं. MHCflurry और cyvcf2 में किए गए बदलाव उनके ओरिजिनल अपस्ट्रीम प्रोजेक्ट्स में शामिल कर लिए गए, जबकि rustar-aligner को नई कम्युनिटी ने आगे संभाला क्योंकि ओरिजिनल प्रोजेक्ट पर अब काम नहीं हो रहा था. जहाँ मौजूदा मेंटेनर्स के साथ मिलकर काम करना संभव हो, वहाँ यह प्रक्रिया जितनी जल्दी शुरू हो सके उतना बेहतर है. अगर अलग इम्प्लीमेंटेशन करना ज़रूरी हो, तो उसके लिए साफ़ तौर पर किसी को ज़िम्मेदारी देने और लंबे समय तक देखभाल की भरोसेमंद योजना होनी चाहिए. वरना आज का आधुनिक री-राइट, कल का छोड़ा हुआ कोड बन सकता है, न कि भरोसेमंद साइंटिफ़िक इन्फ्रास्ट्रक्चर.
यह फ़ील्ड रिपोर्ट पिछले अनुभवों पर आधारित एक शुरुआती अध्ययन है, लेकिन इसमें शामिल केस स्टडीज़ यह दिखाती हैं कि साइंटिफ़िक सॉफ़्टवेयर बनाने का तरीका व्यावहारिक रूप से बदल रहा है. Codex जैसे कोडिंग एजेंट्स मेंटेनेंस, माइग्रेशन, ऑप्टिमाइज़ेशन और नए इम्प्लीमेंटेशन के खर्च को काफ़ी कम कर सकते हैं. लेकिन लंबे समय में उनकी साइंटिफ़िक वैल्यू अब भी इंसानों के फ़ैसलों पर निर्भर करती है—क्या बनाना है, उसे कैसे वैलिडेट करना है और आगे उसकी देखभाल कौन करेगा. असली बदलाव सिर्फ़ इतना नहीं है कि रिसर्चर्स ज़्यादा सॉफ़्टवेयर बना सकते हैं, बल्कि यह है कि वे अपना ज़्यादा समय टूल्स के बारे में फ़ैसले करने, वैलिडेट करने और लंबे समय तक उन्हें बेहतर बनाए रखने पर लगा सकते हैं.
ये केस स्टडीज़ दिखाती हैं कि एजेंट्स आज ही साइंटिफ़िक कंप्यूटिंग में नए बदलावों की रफ़्तार बढ़ा सकते हैं. जैसे-जैसे कोडिंग एजेंट्स बेहतर होते जाएँगे, रिसर्चर्स को एनालिसिस पाइपलाइंस चलाए रखने में कम समय देना पड़ेगा और वे अपने क्षेत्र में नई खोजों पर ज़्यादा ध्यान दे पाएँगे.


