Life Sciences NGS Analysis
अनुक्रमण विश्लेषण के लिए निर्देशित NGS रूटिंग और स्थानीय निष्पादन
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ये कैसे काम करता है
अगली पीढ़ी के अनुक्रमण कार्यप्रवाहों के लिए निर्देशित जानकारी-संग्रह, रूटिंग और निष्पादन प्लगइन. यह Codex को स्थानीय अनुक्रमण इनपुट जाँचने, केवल परीक्षण-विशिष्ट छूटी हुई जानकारी पूछने, जहाँ संभव हो सार्वजनिक या निःशुल्क उपलब्ध और रनटाइम पर इंस्टॉल किए जा सकने वाले पैकेज चुनने, इंस्टॉल करने से पहले मौजूदा टूल की उपलब्धता जाँचने और सत्यापन, लॉग, मेनिफेस्ट, QC रिपोर्ट तथा आउटपुट अनुक्रमणिकाओं के साथ समर्थित स्थानीय कार्यप्रवाह चलाने में मदद करता है. इसमें BCL डीमल्टीप्लेक्सिंग, FASTQ QC निष्पादन और व्याख्या, जर्मलाइन, सोमैटिक तथा UMI-पैनल DNA वेरिएंट, बल्क RNA-seq गणना निर्माण और विभेदक अभिव्यक्ति, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag और अंतर्निहित पोस्ट-काउंट scRNA-seq QC के लिए गहन निर्णय क्षमताएँ शामिल हैं.
आप और क्या कर सकते हैं?
अनुक्रमण गुणवत्ता की समीक्षा करें
जीवन विज्ञान NGS विश्लेषण के लिए इन अनुक्रमण इनपुट की जाँच करें और विश्लेषण का लक्ष्य स्पष्ट करें. समर्थित QC कार्यप्रवाह चुनें, आवश्यक शर्तें जाँचें और सहेजी गई आउटपुट फ़ाइलों की मदद से पूरी हुई रिपोर्टों की व्याख्या करें.
RNA अनुक्रमण विश्लेषण की योजना बनाएँ
जीवन विज्ञान NGS विश्लेषण के लिए इस बल्क RNA-seq अध्ययन के इनपुट और डिज़ाइन की समीक्षा करें. समर्थित विश्लेषण कार्यप्रवाह सुझाएँ, अनुपलब्ध मेटाडेटा पहचानें और निष्पादन से पहले आवश्यक जाँचों को समझाएँ.
अनुक्रमण परिणामों की व्याख्या करें
जीवन विज्ञान NGS विश्लेषण के इन पूर्ण हो चुके अनुक्रमण-विश्लेषण आउटपुट की समीक्षा करें. गुणवत्ता संबंधी समस्याओं और परिणामों का सार बताएँ, निष्कर्षों को मान्यताओं से अलग करें और सहायक फ़ाइलों का संदर्भ दें.
क्या-क्या शामिल है
स्किल्स
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 और
संसाधन
कुछ ही क्लिक में Life Sciences NGS Analysis प्लगइन जोड़ें
उपलब्धता प्लगइन, आपके प्लान और वर्कस्पेस सेटिंग्स पर निर्भर करती है. कुछ कनेक्शन के लिए एडमिन सेटअप या मंज़ूरी की आवश्यकता होती है. अगर एक्सेस ब्लॉक है, तो अपने वर्कस्पेस एडमिन से संपर्क करें.
