איך זה עובד
סביבת עבודה ל-NGS שמלווה את תהליך העבודה: בקרת איכות לקובצי FASTQ, ריצוף RNA בתפזורת וריצוף RNA ברמת התא הבודד. יכולות ממוקדות מזהות את נקודת הפתיחה של המשתמש, מתכננות ניתוח להשגת תוצאה מדעית ומקשרות את התכנון ליכולות הזמינות בפועל ב-Nextflow/nf-core או ב-Snakemake. הן שומרות על מנגנון האישור המובנה המקושר לסכום ביקורת ומפרשות תוצאות שהתקבלו על סמך ראיות מקבצים.
מה עוד אפשר לעשות?
בדיקת איכות הריצוף
NGS Analysis Workbench בדוק את נתוני הריצוף האלה וברר מה מטרת הניתוח. בחר תהליך עבודה נתמך לבקרת איכות, בדוק דרישות מקדימות ופרש את הדוחות שהופקו בעזרת התוצרים שנשמרו.
תכנון ניתוח של ריצוף RNA
NGS Analysis Workbench סקור את נתוני הקלט ואת התכנון של מחקר ריצוף ה-RNA בתפזורת הזה. המלץ על תהליך עבודה נתמך לניתוח, זהה מטא-נתונים חסרים והסבר אילו בדיקות נדרשות לפני ההרצה.
פירוש תוצאות הריצוף
NGS Analysis Workbench סקור את התוצרים האלה של ניתוח הריצוף שהושלם. סכם את בעיות האיכות ואת התוצאות, הבחן בין ממצאים להנחות והפנה לקבצים התומכים.
מה כלול
מיומנויות
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
משאבים
הוספת התוסף NGS Analysis Workbench בכמה לחיצות
הזמינות תלויה בתוסף, בתוכנית שלכם ובהגדרות ה-workspace. חלק מהחיבורים דורשים הגדרה או אישור של מנהל מערכת. אם הגישה חסומה, פנו למנהל ה-workspace שלכם.
גלו תוספים קשורים
Data
תשובות לשאלות בעזרת נתונים
Life Sciences Literature
איתור מאמרים ביו־רפואיים, גרסאות טרום־פרסום וטקסט מלא בגישה פתוחה
Life Sciences NGS Analysis
בחירה מונחית של מסלול ניתוח NGS והרצה מקומית לניתוח נתוני ריצוף
BioRender
חיפוש ויצירת איורים
Documents
יצירה ועריכה של מסמכים
Zotero
מצאו מאמרים והוסיפו הפניות מ-Zotero
