NGS Analysis Workbench
Suriin ang sequencing data
- Mga Kakayahan
- Interactive, Read, Write
- Kategorya
- Data
- Developer
- OpenAI
Paano ito gumagana
Isang NGS workbench na gumagabay sa bawat yugto ng FASTQ QC, bulk RNA-seq, at single-cell RNA-seq. Tinutukoy ng mga espesyalisadong kakayahan kung saan magsisimula ang user, bumubuo ng disenyo tungo sa isang siyentipikong resulta, at iniuugnay ang disenyong iyon sa aktuwal na magagamit na mga kakayahan ng Nextflow/nf-core o Snakemake. Pinapanatili rin ng mga ito ang katutubong mekanismo ng pag-apruba na nakatali sa checksum at binibigyang-kahulugan ang mga nakumpletong resulta batay sa ebidensiyang nasa mga file.
Ano pa ang magagawa mo?
Suriin ang kalidad ng sequencing
NGS Analysis Workbench Suriin ang mga sequencing input na ito at linawin ang layunin ng pagsusuri. Pumili ng suportadong QC workflow, tingnan ang mga kailangan, at ipaliwanag ang mga natapos na ulat gamit ang mga naka-save na artifact.
Magplano ng pagsusuri sa RNA sequencing
NGS Analysis Workbench Suriin ang mga input at disenyo ng pag-aaral na ito sa bulk RNA-seq. Magmungkahi ng suportadong workflow sa pagsusuri, tukuyin ang kulang na metadata, at ipaliwanag ang mga dapat suriin bago ito patakbuhin.
Ipaliwanag ang mga resulta ng sequencing
NGS Analysis Workbench Suriin ang mga output na ito mula sa natapos na sequencing analysis. Ibuod ang mga isyu sa kalidad at resulta, ihiwalay ang mga natuklasan sa mga palagay, at banggitin ang mga file na sumusuporta sa mga ito.
Ano'ng kasama
Skill
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Mga Mapagkukunan
Idagdag ang NGS Analysis Workbench plugin sa ilang pag-click lang
Nakadepende ang availability sa plugin, iyong plano, at mga setting ng workspace. Nangangailangan ang ilang koneksyon ng pag-set up o pag-apruba ng admin. Makipag-ugnayan sa admin ng iyong workspace kung naka-block ang access.
Tuklasin ang mga kaugnay na plugin
Data
Gawing malinaw na desisyon ang data.
Life Sciences Literature
Maghanap ng mga biomedical na papel, preprint, at open-access na buong teksto
Life Sciences NGS Analysis
May gabay na pagruruta ng NGS at lokal na pagsasagawa para sa pagsusuri ng sequencing
BioRender
Maghanap at gumawa ng mga pigura
Documents
Gumawa at mag-edit ng mga dokumento
Zotero
Humanap ng mga pag-aaral at magdagdag ng mga pagsipi mula sa Zotero
