NGS Analysis Workbench
Analitza dades de seqüenciació
- Capacitats
- Interactive, Read, Write
- Categoria
- Dades
- Desenvolupador
- OpenAI
- Lloc web
- (s'obre en una finestra nova)
Com funciona
Un entorn de treball NGS que acompanya tot el procés de control de qualitat de FASTQ, RNA-seq massiu i RNA-seq de cèl·lula única. Les capacitats especialitzades determinen el punt de partida de l'usuari, dissenyen l'anàlisi per assolir un resultat científic, vinculen aquest disseny a les funcionalitats disponibles de Nextflow/nf-core o Snakemake, preserven l'aprovació nativa vinculada a una suma de verificació i interpreten els resultats finals a partir d'evidències documentades en fitxers.
Què més pots fer?
Revisa la qualitat de la seqüenciació
NGS Analysis Workbench Revisa aquestes dades de seqüenciació d'entrada i aclareix l'objectiu de l'anàlisi. Tria un flux de control de qualitat compatible, comprova els requisits previs i interpreta els informes finals amb els artefactes desats.
Planifica l'anàlisi de seqüenciació d'ARN
NGS Analysis Workbench Revisa les dades d'entrada i el disseny d'aquest estudi d'RNA-seq massiu. Recomana un flux d'anàlisi compatible, identifica les metadades que falten i explica les comprovacions necessàries abans de l'execució.
Interpreta els resultats de seqüenciació
NGS Analysis Workbench Revisa aquests resultats finals de l'anàlisi de seqüenciació. Resumeix els problemes de qualitat i els resultats, distingeix les troballes de les suposicions i cita els fitxers que les sustenten.
Què inclou
Skills
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Recursos
Afegeix el connector NGS Analysis Workbench en uns quants clics
La disponibilitat depèn del connector, del teu pla i de la configuració de l'espai de treball. Algunes connexions requereixen configuració o aprovació d'un administrador. Contacta amb l'administrador del teu espai de treball si l'accés està bloquejat.
Explora connectors relacionats
Data
Converteix les dades en decisions clares.
Life Sciences Literature
Cerca articles biomèdics, prepublicacions i textos complets d'accés obert
Life Sciences NGS Analysis
Encaminament guiat d'NGS i execució local d'anàlisis de seqüenciació
BioRender
Cercar i crear figures
Documents
Crea i edita documents
Zotero
Troba articles i afegeix citacions des de Zotero
