NGS Analysis Workbench
Analizirajte podatke sekvenciranja
- Mogućnosti
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Podaci
- Programer
- OpenAI
- Web stranica
- (otvara se u novom prozoru)
Kako to radi
Radno okruženje koje vas vodi kroz NGS analizu: kontrolu kvaliteta FASTQ podataka, RNA-seq analizu zbirnih uzoraka i RNA-seq analizu pojedinačnih ćelija. Specijalizirane vještine utvrđuju korisnikovu polaznu tačku, izrađuju plan prema naučnom cilju, povezuju ga s trenutno dostupnim mogućnostima alata Nextflow/nf-core ili Snakemake, čuvaju izvorno odobrenje vezano za kontrolnu sumu i tumače konačne rezultate na osnovu dokaza iz datoteka.
Šta još možeš uraditi?
Provjerite kvalitet sekvenciranja
NGS Analysis Workbench pregledaj ove ulazne podatke sekvenciranja i razjasni cilj analize. Odaberi podržani tok rada za kontrolu kvaliteta, provjeri preduslove i protumači završene izvještaje uz sačuvane artefakte.
Planirajte analizu RNA sekvenciranja
NGS Analysis Workbench pregledaj ulazne podatke i plan ove RNA-seq studije zbirnih uzoraka. Preporuči podržani tok analize, utvrdi koji metapodaci nedostaju i objasni potrebne provjere prije pokretanja.
Protumačite rezultate sekvenciranja
NGS Analysis Workbench pregledaj ove rezultate završene analize podataka sekvenciranja. Sažmi probleme s kvalitetom i rezultate, razdvoji nalaze od pretpostavki i navedi datoteke koje ih potkrepljuju.
Šta je uključeno
Vještine
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Resursi
Dodaj dodatak NGS Analysis Workbench u nekoliko klikova
Dostupnost zavisi od dodatka, tvog paketa i postavki radnog prostora. Za neke veze potrebno je administratorsko podešavanje ili odobrenje. Obrati se administratoru radnog prostora ako je pristup blokiran.
Istraži povezane dodatke
Data
Pretvorite podatke u jasne odluke.
Life Sciences Literature
Pronađite biomedicinske radove, preprinte i cjelovite tekstove u otvorenom pristupu
Life Sciences NGS Analysis
Vođeno NGS usmjeravanje i lokalno izvršavanje analize sekvenciranja
BioRender
Pronađite i izradite slike
Documents
Kreirajte i uređujte dokumente
Zotero
Pronađite radove i dodajte citate iz aplikacije Zotero
