Life Sciences NGS Analysis
Vođeno NGS usmjeravanje i lokalno izvršavanje analize sekvenciranja
- Mogućnosti
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Edukacija
- Programer
- OpenAI
- Web stranica
- (otvara se u novom prozoru)
Kako to radi
Vođeni dodatak za prijem podataka, usmjeravanje i izvršavanje radnih tokova sekvenciranja nove generacije. Pomaže Codexu da pregleda lokalne ulazne podatke sekvenciranja, postavi samo pitanja specifična za test na koja nedostaju odgovori, odabere javne ili besplatno dostupne pakete koji se mogu instalirati tokom izvođenja, provjeri dostupnost postojećih alata prije instalacije te izvrši podržane lokalne radne tokove uz provjeru valjanosti, zapisnike, manifeste, izvještaje o kontroli kvaliteta i indekse artefakata. Obuhvata naprednije odlučivanje za BCL demultipleksiranje, izvršavanje i tumačenje kontrole kvaliteta FASTQ podataka, germinativne i somatske varijante te varijante DNK iz UMI panela, generiranje broja očitanja i diferencijalnu ekspresiju za skupno RNA-seq sekvenciranje, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag te ugrađenu kontrolu kvaliteta scRNA-seq podataka nakon prebrojavanja.
Šta još možeš uraditi?
Pregled kvaliteta sekvenciranja
NGS analiza u biološkim naukama: pregledaj ove ulazne podatke sekvenciranja i razjasni cilj analize. Odaberi podržani proces kontrole kvaliteta, provjeri preduslove te protumači završene izvještaje i spremljene artefakte.
Planiranje analize RNA sekvenciranja
NGS analiza u biološkim naukama: pregledaj ulazne podatke i dizajn ove studije skupnog RNA-seq sekvenciranja. Preporuči podržani proces analize, utvrdi koji metapodaci nedostaju i objasni potrebne provjere prije izvršavanja.
Tumačenje rezultata sekvenciranja
NGS analiza u biološkim naukama: pregledaj ove završene rezultate analize sekvenciranja. Sažmi probleme s kvalitetom i rezultate, odvoji nalaze od pretpostavki i navedi prateće datoteke.
Šta je uključeno
Vještine
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 više
Resursi
Dodaj dodatak Life Sciences NGS Analysis u nekoliko klikova
Dostupnost zavisi od dodatka, tvog paketa i postavki radnog prostora. Za neke veze potrebno je administratorsko podešavanje ili odobrenje. Obrati se administratoru radnog prostora ako je pristup blokiran.
Istraži povezane dodatke
Data
Pretvorite podatke u jasne odluke.
Life Sciences Literature
Pronađite biomedicinske radove, preprinte i cjelovite tekstove u otvorenom pristupu
NGS Analysis Workbench
Analizirajte podatke sekvenciranja
BioRender
Pronađite i izradite slike
Documents
Kreirajte i uređujte dokumente
Zotero
Pronađite radove i dodajte citate iz aplikacije Zotero
