NGS Analysis Workbench
Analyzujte sekvenačné dáta
- Funkcie
- Interactive, Read, Write
- Kategória
- Údaje
- Vývojár
- OpenAI
- Webová lokalita
- (otvorí sa v novom okne)
Ako to funguje
Pracovné prostredie NGS, ktoré vás prevedie kontrolou kvality FASTQ, hromadnou RNA-seq a jednobunkovou RNA-seq. Špecializované funkcie určia východiskovú situáciu používateľa, navrhnú postup na dosiahnutie vedeckého výsledku a prepoja ho s aktuálne dostupnými možnosťami Nextflow/nf-core alebo Snakemake. Zachovajú schvaľovanie priamo v systéme viazané na kontrolný súčet a interpretujú hotové výsledky na základe podkladov uložených v súboroch.
Čo ešte dokážeš?
Posúďte kvalitu sekvenovania
NGS Analysis Workbench Preskúmaj tieto vstupné sekvenačné dáta a ujasni cieľ analýzy. Vyber podporovaný postup kontroly kvality, over predpoklady a interpretuj hotové správy pomocou uložených artefaktov.
Naplánujte analýzu sekvenovania RNA
NGS Analysis Workbench Preskúmaj vstupné dáta a návrh tejto štúdie hromadnej RNA-seq. Odporuč podporovaný analytický postup, identifikuj chýbajúce metadáta a vysvetli, čo treba skontrolovať pred spustením.
Interpretujte výsledky sekvenovania
NGS Analysis Workbench Preskúmaj tieto hotové výstupy analýzy sekvenačných dát. Zhrň problémy s kvalitou a výsledky, odlíš zistenia od predpokladov a uveď odkazy na podporné súbory.
Čo je zahrnuté
Zručností
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Zdroje
Pridaj doplnok NGS Analysis Workbench niekoľkými kliknutiami
Dostupnosť závisí od doplnku, tvojho plánu a nastavení pracovného priestoru. Niektoré pripojenia vyžadujú nastavenie alebo schválenie správcom. Ak je prístup zablokovaný, kontaktuj správcu pracovného priestoru.
Preskúmaj súvisiace doplnky
Data
Premeňte údaje na jednoznačné rozhodnutia.
Life Sciences Literature
Nájdite biomedicínske články, preprinty a voľne dostupné plné texty
Life Sciences NGS Analysis
Riadené smerovanie NGS a lokálne vykonávanie sekvenačných analýz
BioRender
Vyhľadávajte a vytvárajte obrázky
Documents
Vytvárajte a upravujte dokumenty
Zotero
Vyhľadávajte odborné články a pridávajte citácie zo Zotero
