Life Sciences NGS Analysis
Riadené smerovanie NGS a lokálne vykonávanie sekvenačných analýz
- Funkcie
- Interactive, Read, Write
- Kategória
- Vzdelanie
- Vývojár
- OpenAI
- Webová lokalita
- (otvorí sa v novom okne)
Ako to funguje
Doplnok so sprievodcom na zber vstupných údajov, smerovanie a vykonávanie pracovných postupov sekvenovania novej generácie. Pomáha modelu Codex preskúmať lokálne vstupy sekvenovania, položiť iba chýbajúce otázky špecifické pre daný test, podľa možnosti vybrať verejné alebo voľne dostupné balíky inštalovateľné za behu, pred inštaláciou overiť dostupnosť existujúcich nástrojov a vykonať podporované lokálne pracovné postupy vrátane validácie, protokolov, manifestov, správ QC a indexov artefaktov. Zahŕňa pokročilé rozhodovacie schopnosti pre demultiplexovanie BCL, vykonávanie a interpretáciu QC súborov FASTQ, germinálne, somatické a UMI panelové varianty DNA, generovanie počtov a diferenciálnu expresiu pri hromadnom RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag aj integrovanú QC scRNA-seq po spočítaní.
Čo ešte dokážeš?
Kontrola kvality sekvenovania
Analýza NGS v biologických vedách: Preskúmaj tieto sekvenačné vstupy a objasni cieľ analýzy. Vyber podporovaný pracovný postup QC, skontroluj predpoklady a interpretuj dokončené správy spolu s uloženými artefaktmi.
Plánovanie analýzy sekvenovania RNA
Analýza NGS v biologických vedách: Preskúmaj vstupy a návrh tejto štúdie hromadného RNA-seq. Odporuč podporovaný analytický postup, urči chýbajúce metaúdaje a vysvetli kontroly potrebné pred spustením.
Interpretácia výsledkov sekvenovania
Analýza NGS v biologických vedách: Preskúmaj tieto dokončené výstupy sekvenačnej analýzy. Zhrň problémy s kvalitou a výsledky, odlíš zistenia od predpokladov a odkáž na podporné súbory.
Čo je zahrnuté
Zručností
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 viac
Zdroje
Pridaj doplnok Life Sciences NGS Analysis niekoľkými kliknutiami
Dostupnosť závisí od doplnku, tvojho plánu a nastavení pracovného priestoru. Niektoré pripojenia vyžadujú nastavenie alebo schválenie správcom. Ak je prístup zablokovaný, kontaktuj správcu pracovného priestoru.
Preskúmaj súvisiace doplnky
Data
Premeňte údaje na jednoznačné rozhodnutia.
Life Sciences Literature
Nájdite biomedicínske články, preprinty a voľne dostupné plné texty
NGS Analysis Workbench
Analyzujte sekvenačné dáta
BioRender
Vyhľadávajte a vytvárajte obrázky
Documents
Vytvárajte a upravujte dokumenty
Zotero
Vyhľadávajte odborné články a pridávajte citácie zo Zotero
