NGS Analysis Workbench
Analizuj dane z sekwencjonowania
- Możliwości
- Interactive, Read, Write
- Kategoria
- Dane
- Programista
- OpenAI
- Witryna internetowa
- (otwiera nowe okno)
Jak to działa?
Środowisko analizy NGS prowadzące przez kolejne etapy kontroli jakości FASTQ, zbiorczego RNA-seq i jednokomórkowego RNA-seq. Wyspecjalizowane umiejętności określają punkt wyjścia użytkownika, planują analizę pod kątem celu naukowego, dopasowują plan do aktualnie dostępnych możliwości Nextflow/nf-core lub Snakemake, zachowują natywne zatwierdzenia powiązane z sumami kontrolnymi i interpretują gotowe wyniki na podstawie danych zapisanych w plikach.
Co jeszcze potrafisz?
Oceń jakość sekwencjonowania
NGS Analysis Workbench sprawdź te wejściowe dane z sekwencjonowania i doprecyzuj cel analizy. Wybierz obsługiwany proces kontroli jakości, sprawdź wymagania wstępne i zinterpretuj gotowe raporty na podstawie zapisanych artefaktów.
Zaplanuj analizę sekwencjonowania RNA
NGS Analysis Workbench przejrzyj dane wejściowe i plan tego badania zbiorczego RNA-seq. Zalecany proces analizy wybierz spośród obsługiwanych, wskaż brakujące metadane i wyjaśnij, co należy sprawdzić przed uruchomieniem.
Zinterpretuj wyniki sekwencjonowania
NGS Analysis Workbench przejrzyj te wyniki ukończonej analizy danych z sekwencjonowania. Podsumuj problemy z jakością i wyniki, odróżnij ustalenia od założeń i wskaż pliki potwierdzające ustalenia.
Co otrzymujesz
Umiejętności
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Zasoby
Dodaj wtyczkę NGS Analysis Workbench kilkoma kliknięciami
Dostępność zależy od wtyczki, Twojego planu i ustawień przestrzeni roboczej. Niektóre połączenia wymagają konfiguracji lub zatwierdzenia przez administratora. Jeśli dostęp jest zablokowany, skontaktuj się z administratorem swojej przestrzeni roboczej.
Poznaj powiązane wtyczki
Data
Przekształcaj dane w trafne decyzje.
Life Sciences Literature
Znajdź artykuły biomedyczne, preprinty i pełne teksty w otwartym dostępie
Life Sciences NGS Analysis
Dobór ścieżki NGS i lokalne wykonywanie analiz sekwencjonowania z instrukcjami
BioRender
Znajduj i twórz ryciny
Documents
Twórz i edytuj dokumenty
Zotero
Znajduj publikacje i dodawaj cytowania z Zotero
