Life Sciences NGS Analysis

၎င်းအလုပ်လုပ်ပုံ

မျိုးဆက်သစ် sequencing လုပ်ငန်းစဉ်များအတွက် အချက်အလက်လက်ခံခြင်း၊ လမ်းကြောင်းရွေးချယ်ခြင်းနှင့် လုပ်ဆောင်ခြင်းတို့ကို လမ်းညွှန်ပေးသည့် ပလပ်အင်။ ၎င်းသည် Codex အား စက်တွင်း sequencing input များကို စစ်ဆေးခြင်း၊ လိုအပ်နေသည့် စမ်းသပ်မှုအလိုက် မေးခွန်းများကိုသာ မေးမြန်းခြင်း၊ ဖြစ်နိုင်ပါက အများသုံး သို့မဟုတ် အခမဲ့ရယူနိုင်ပြီး လုပ်ဆောင်ချိန်တွင် ထည့်သွင်းနိုင်သော package များကို ရွေးချယ်ခြင်း၊ မထည့်သွင်းမီ ရှိပြီးသား tool များကို စစ်ဆေးခြင်းနှင့် validation၊ log၊ manifest၊ QC အစီရင်ခံစာ၊ artifact အညွှန်းတို့ပါဝင်သည့် ပံ့ပိုးထားသော စက်တွင်းလုပ်ငန်းစဉ်များကို လုပ်ဆောင်ခြင်းတို့တွင် ကူညီပေးသည်။ BCL demultiplexing၊ FASTQ QC လုပ်ဆောင်ခြင်းနှင့် အဓိပ္ပာယ်ကောက်ယူခြင်း၊ germline၊ somatic နှင့် UMI-panel DNA variant များ၊ bulk RNA-seq count ထုတ်ခြင်းနှင့် differential expression၊ ATAC-seq၊ ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag နှင့် count ထုတ်ပြီးနောက် ထည့်သွင်းလုပ်ဆောင်သော scRNA-seq QC တို့အတွက် အဆင့်မြင့် ဆုံးဖြတ်ချက်ချနိုင်စွမ်းများ ပါဝင်သည်။

ပါဝင်သည့်အရာများ

အရင်းအမြစ်များ