Life Sciences NGS Analysis
Водено насочување на NGS и локално извршување на анализата на секвенционирање
- Способности
- Interactive, Read, Write
- Категорија
- Образование
- Програмер
- OpenAI
- Веб-локација
- (се отвора во нов прозорец)
Како функционира
Приклучок со водено внесување, насочување и извршување на работни текови за секвенционирање од следната генерација. Му помага на Codex да ги прегледа локалните влезни податоци од секвенционирањето, да ги постави само неодговорените прашања специфични за анализата, да избере јавни или бесплатно достапни пакети што може да се инсталираат при извршување, да ја провери достапноста на постојните алатки пред инсталација и да изврши поддржани локални работни текови со валидација, дневници, манифести, извештаи за контрола на квалитетот и индекси на артефакти. Вклучува напредни способности за одлучување за демултиплексирање BCL, извршување и толкување на контрола на квалитетот на FASTQ, герминативни, соматски и UMI-панелни варијанти на ДНК, генерирање броеви и диференцијална експресија за збирно RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag и вградена контрола на квалитетот по броењето за scRNA-seq.
Што друго можете да направите?
Проверка на квалитетот на секвенционирањето
NGS-анализа во природните науки: прегледај ги овие влезни податоци од секвенционирањето и појасни ја целта на анализата. Избери поддржан процес за контрола на квалитетот, провери ги предусловите и протолкувај ги завршените извештаи со зачуваните артефакти.
Планирање анализа на RNA-секвенционирање
NGS-анализа во природните науки: прегледај ги влезните податоци и дизајнот на оваа студија со збирно RNA-seq. Препорачај поддржан процес за анализа, утврди кои метаподатоци недостигаат и објасни ги проверките потребни пред извршувањето.
Толкување на резултатите од секвенционирањето
NGS-анализа во природните науки: прегледај ги овие готови резултати од анализата на секвенционирањето. Резимирај ги проблемите со квалитетот и резултатите, разграничи ги наодите од претпоставките и наведи ги придружните датотеки.
Што е вклучено
Вештини
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 повеќе
Ресурси
Додајте го приклучокот Life Sciences NGS Analysis со неколку кликнувања
Достапноста зависи од приклучокот, вашиот план и поставките на работниот простор. За некои врски е потребно администраторско поставување или одобрување. Контактирајте со администраторот на работниот простор ако пристапот е блокиран.
Разгледајте ги поврзаните приклучоци
Data
Претворете ги податоците во јасни одлуки.
Life Sciences Literature
Најдете биомедицински трудови, препринти и целосни текстови со отворен пристап
NGS Analysis Workbench
Анализирајте податоци од секвенционирање
BioRender
Најдете и создавајте слики
Documents
Создавајте и уредувајте документи
Zotero
Најдете трудови и додајте цитирања од Zotero
