NGS Analysis Workbench
Секвенирлеу деректерін талдау
- Мүмкіндіктер
- Interactive, Read, Write
- Санат
- Деректер
- Әзірлеуші
- OpenAI
- Веб-сайт
- (жаңа терезеде ашылады)
Қалай жұмыс істейді
FASTQ сапасын бақылауға, жиынтық және бір жасушалық RNA-seq талдауына арналған, жұмыс кезеңдері бойынша бағыттайтын NGS ортасы. Арнайы дағдылар пайдаланушының бастапқы жағдайын анықтап, ғылыми нәтижеге жету жоспарын құрады, оны Nextflow/nf-core немесе Snakemake жүйелерінің қолданыстағы мүмкіндіктерімен байланыстырады, бақылау сомасына байланған жүйелік мақұлдауды сақтайды және дайын нәтижелерді файлдардағы дәлелдерге сүйеніп түсіндіреді.
Тағы не істеуге болады?
Секвенирлеу сапасын тексеру
NGS Analysis Workbench, осы бастапқы секвенирлеу деректерін тексеріп, талдау мақсатын нақтыла. Қолдау көрсетілетін сапаны бақылау процесін таңда, алғышарттарды тексер және сақталған артефактілерге сүйеніп, дайын есептерді түсіндір.
РНҚ секвенирлеу талдауын жоспарлау
NGS Analysis Workbench, осы жиынтық RNA-seq зерттеуінің бастапқы деректері мен жоспарын қарастыр. Қолдау көрсетілетін талдау процесін ұсын, жетіспейтін метадеректерді анықта және іске қосар алдында нені тексеру керегін түсіндір.
Секвенирлеу нәтижелерін түсіндіру
NGS Analysis Workbench, секвенирлеу талдауының осы дайын нәтижелерін қарастыр. Сапа мәселелері мен нәтижелерін қорытындыла, анықталған жайттарды болжамдардан ажырат және растайтын файлдарға сілтеме бер.
Қамтылған мүмкіндіктер
Дағдылар
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Ресурстар
Бірнеше рет басып, NGS Analysis Workbench плагинін қосыңыз
Қолжетімділік плагинге, жоспарыңызға және жұмыс кеңістігінің параметрлеріне байланысты. Кейбір қосылымдар әкімшінің баптауын немесе мақұлдауын талап етеді. Қолжетімділік бұғатталған болса, жұмыс кеңістігіңіздің әкімшісіне хабарласыңыз.
Қатысты плагиндерді шолу
Data
Деректерді нақты шешімдерге айналдырыңыз.
Life Sciences Literature
Биомедициналық мақалаларды, препринттерді және ашық толық мәтінді табыңыз
Life Sciences NGS Analysis
Секвенирлеуді талдау үшін NGS үдерісін бағыттап, жергілікті орындау
BioRender
Суреттерді табу және жасау
Documents
Құжаттарды жасау және өңдеу
Zotero
Zotero ішінен мақалалар тауып, оларға сілтемелер қосыңыз
