Life Sciences NGS Analysis
Секвенирлеуді талдау үшін NGS үдерісін бағыттап, жергілікті орындау
- Мүмкіндіктер
- Interactive, Read, Write
- Санат
- Білім
- Әзірлеуші
- OpenAI
- Веб-сайт
- (жаңа терезеде ашылады)
Қалай жұмыс істейді
Жаңа буын секвенирлеу жұмыс үдерістерінде деректерді бағыттап қабылдауға, бағдарлауға және орындауға арналған плагин. Ол Codex-ке жергілікті секвенирлеу кірістерін тексеруге, сынаққа қатысты жетіспейтін сұрақтарды ғана қоюға, мүмкіндігінше жалпыға ашық немесе тегін әрі орындалу кезінде орнатылатын пакеттерді таңдауға, орнатпас бұрын қолда бар құралдарды тексеруге және қолдау көрсетілетін жергілікті жұмыс үдерістерін валидациямен, журналдармен, манифестермен, QC есептерімен және артефакт индекстерімен орындауға көмектеседі. Ол BCL демультиплекстеуіне, FASTQ QC үдерісін орындау мен түсіндіруге, ұрық желісіндегі, сомалық және UMI-панельдік ДНҚ нұсқаларына, bulk RNA-seq санауларын құру мен дифференциалды экспрессияға, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag және санаудан кейінгі кіріктірілген scRNA-seq QC үдерісіне арналған тереңдетілген шешім қабылдау мүмкіндіктерін қамтиды.
Тағы не істеуге болады?
Секвенирлеу сапасын бағалау
Өмір туралы ғылымдардағы NGS талдауы Осы секвенирлеу кірістерін тексеріп, талдау мақсатын нақтылаңыз. Қолдау көрсетілетін QC жұмыс үдерісін таңдап, алғышарттарды тексеріңіз және сақталған артефактілері бар дайын есептерді түсіндіріңіз.
RNA секвенирлеу талдауын жоспарлау
Өмір туралы ғылымдардағы NGS талдауы Осы bulk RNA-seq зерттеуінің кірістері мен дизайнын қарап шығыңыз. Қолдау көрсетілетін талдау үдерісін ұсынып, жетіспейтін метадеректерді анықтаңыз және орындау алдындағы қажетті тексерулерді түсіндіріңіз.
Секвенирлеу нәтижелерін түсіндіру
Өмір туралы ғылымдардағы NGS талдауы Секвенирлеу талдауының дайын нәтижелерін қарап шығыңыз. Сапа мәселелері мен нәтижелерді қорытындылап, тұжырымдарды болжамдардан ажыратыңыз және оларды растайтын файлдарға сілтеме жасаңыз.
Қамтылған мүмкіндіктер
Дағдылар
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- Тағы 10 көп
Ресурстар
Бірнеше рет басып, Life Sciences NGS Analysis плагинін қосыңыз
Қолжетімділік плагинге, жоспарыңызға және жұмыс кеңістігінің параметрлеріне байланысты. Кейбір қосылымдар әкімшінің баптауын немесе мақұлдауын талап етеді. Қолжетімділік бұғатталған болса, жұмыс кеңістігіңіздің әкімшісіне хабарласыңыз.
Қатысты плагиндерді шолу
Data
Деректерді нақты шешімдерге айналдырыңыз.
Life Sciences Literature
Биомедициналық мақалаларды, препринттерді және ашық толық мәтінді табыңыз
NGS Analysis Workbench
Секвенирлеу деректерін талдау
BioRender
Суреттерді табу және жасау
Documents
Құжаттарды жасау және өңдеу
Zotero
Zotero ішінен мақалалар тауып, оларға сілтемелер қосыңыз
