NGS Analysis Workbench
Analizirajte podatke sekvenciranja
- Sposobnosti
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Podaci
- Razvojni inženjer
- OpenAI
- Mrežna lokacija
- (otvara se u novom prozoru)
Način rada
Radno okruženje za NGS koje vodi kroz kontrolu kvalitete podataka FASTQ, RNA-seq na skupnim uzorcima i RNA-seq pojedinačnih stanica. Specijalizirane vještine utvrđuju korisnikovo polazište, osmišljavaju analizu prema znanstvenom cilju i povezuju je s trenutačno dostupnim mogućnostima alata Nextflow/nf-core ili Snakemake. Pritom čuvaju izvorno odobrenje vezano uz kontrolni zbroj i tumače konačne rezultate na temelju dokaza iz datoteka.
Što još možete učiniti?
Provjerite kvalitetu sekvenciranja
NGS Analysis Workbench Pregledaj ove ulazne podatke sekvenciranja i razjasni cilj analize. Odaberi podržani tijek rada za kontrolu kvalitete, provjeri preduvjete i protumači gotova izvješća uz pomoć spremljenih artefakata.
Isplanirajte analizu sekvenciranja RNA
NGS Analysis Workbench Pregledaj ulazne podatke i nacrt ovog istraživanja RNA-seq na skupnim uzorcima. Preporuči podržani tijek analize, utvrdi koji metapodaci nedostaju i objasni potrebne provjere prije izvođenja.
Protumačite rezultate sekvenciranja
NGS Analysis Workbench Pregledaj ove rezultate dovršene analize sekvenciranja. Sažmi probleme s kvalitetom i rezultate, razluči nalaze od pretpostavki te navedi datoteke koje ih potkrepljuju.
Što je uključeno
Vještina
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Resursi
Dodajte plugin NGS Analysis Workbench u nekoliko klikova
Dostupnost ovisi o pluginu, vašem planu i postavkama radnog prostora. Neke veze zahtijevaju postavljanje ili odobrenje administratora. Obratite se administratoru radnog prostora ako je pristup blokiran.
Istražite povezane plugine
Data
Pretvorite podatke u jasne odluke.
Life Sciences Literature
Pronađite biomedicinske radove, predpublikacije i cjelovite tekstove u otvorenom pristupu
Life Sciences NGS Analysis
Vođeno usmjeravanje NGS-a i lokalno izvođenje analize sekvenciranja
BioRender
Pronađite i izradite ilustracije
Documents
Izrađujte i uređujte dokumente
Zotero
Pronađite radove i dodajte citate iz Zotera
