NGS Analysis Workbench
Analysoi sekvensointidataa
- Kyvykkyydet
- Interactive, Read, Write
- Luokka
- Data
- Kehittäjä
- OpenAI
- Verkkosivusto
- (avautuu uudessa ikkunassa)
Miten se toimii
Työnkulun eri vaiheita tukeva NGS-työympäristö FASTQ-laadunvalvontaan sekä bulkki- ja yksisolutason RNA-seq-analyyseihin. Erikoistuneet toiminnot selvittävät käyttäjän lähtötilanteen, suunnittelevat analyysin tieteellisen tavoitteen pohjalta ja sovittavat suunnitelman käytettävissä oleviin Nextflow/nf-core- tai Snakemake-ominaisuuksiin. Ne säilyttävät työkalun oman, tarkistussummaan sidotun hyväksynnän ja tulkitsevat valmiit tulokset tiedostoihin tallennetun näytön perusteella.
Mitä muuta voit tehdä?
Tarkasta sekvensoinnin laatu
NGS Analysis Workbench Tarkasta nämä sekvensointiaineistot ja selvennä analyysin tavoite. Valitse tuettu laadunvalvonnan työnkulku, tarkista edellytykset ja tulkitse valmiit raportit tallennettujen tuotosten avulla.
Suunnittele RNA-sekvensointianalyysi
NGS Analysis Workbench Tarkasta tämän bulkki-RNA-seq-tutkimuksen lähtöaineistot ja koeasetelma. Suosittele tuettua analyysityönkulkua, tunnista puuttuvat metatiedot ja kerro, mitä tarkistuksia tarvitaan ennen suoritusta.
Tulkitse sekvensoinnin tulokset
NGS Analysis Workbench Tarkasta nämä valmiit sekvensointianalyysin tuotokset. Tee yhteenveto laatuongelmista ja tuloksista, erota havainnot oletuksista ja viittaa niitä tukeviin tiedostoihin.
Sisältö
Taidot
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Resurssit
Lisää NGS Analysis Workbench -lisäosa muutamalla klikkauksella
Saatavuus riippuu lisäosasta, tilauksestasi ja työtilan asetuksista. Jotkin yhteydet edellyttävät ylläpitäjän määritystä tai hyväksyntää. Ota yhteyttä työtilasi ylläpitäjään, jos käyttöoikeus on estetty.
Tutustu aiheeseen liittyviin lisäosiin
Data
Muunna data selkeiksi päätöksiksi.
Life Sciences Literature
Etsi biolääketieteen artikkeleita, esipainoksia ja avoimia kokotekstejä
Life Sciences NGS Analysis
Ohjattu NGS-työnkulun valinta ja paikallinen suoritus sekvensointianalyysiin
BioRender
Etsi ja luo kuvia
Documents
Luo ja muokkaa asiakirjoja
Zotero
Etsi tutkimusartikkeleita ja lisää lähdeviitteitä Zoterosta
