Life Sciences NGS Analysis
Ohjattu NGS-työnkulun valinta ja paikallinen suoritus sekvensointianalyysiin
- Kyvykkyydet
- Interactive, Read, Write
- Luokka
- Koulutus
- Kehittäjä
- OpenAI
- Verkkosivusto
- (avautuu uudessa ikkunassa)
Miten se toimii
Ohjattu lisäosa lähtötietojen keräämiseen, työnkulkujen valintaan ja suorittamiseen uuden sukupolven sekvensoinnissa. Se auttaa Codexia tarkistamaan paikalliset sekvensointisyötteet, kysymään vain puuttuvat määrityskohtaiset kysymykset, valitsemaan mahdollisuuksien mukaan julkisia tai vapaasti saatavilla olevia ja ajon aikana asennettavia paketteja, tarkistamaan työkalujen saatavuuden ennen asennusta sekä suorittamaan tuettuja paikallisia työnkulkuja. Suorituksiin sisältyvät validointi, lokit, manifestit, QC-raportit ja tuotosten hakemistot. Se sisältää syvällisiä päätöksentekovalmiuksia BCL-demultipleksointiin, FASTQ-laadunvalvonnan suorittamiseen ja tulkintaan, ituradan, somaattisten ja UMI-paneelien DNA-varianttien analysointiin, RNA-seq-massadatan lukumäärien tuottamiseen ja differentiaalisen ilmentymisen analyysiin, ATAC-seq-, ChIP-seq-, CUT&RUN- ja CUT&Tag-menetelmiin sekä integroituun scRNA-seq-laadunvalvontaan lukumäärien laskennan jälkeen.
Mitä muuta voit tehdä?
Arvioi sekvensoinnin laatu
Biotieteiden NGS-analyysi: tarkista nämä sekvensointisyötteet ja täsmennä analyysin tavoite. Valitse tuettu QC-työnkulku, tarkista edellytykset ja tulkitse valmiit raportit sekä tallennetut tuotokset.
Suunnittele RNA-sekvensointianalyysi
Biotieteiden NGS-analyysi: tarkista tämän RNA-seq-massatutkimuksen syötteet ja tutkimusasetelma. Suosittele tuettua analyysityönkulkua, tunnista puuttuvat metatiedot ja selitä ennen suoritusta tarvittavat tarkistukset.
Tulkitse sekvensointituloksia
Biotieteiden NGS-analyysi: tarkista nämä valmiit sekvensointianalyysin tuotokset. Tee yhteenveto laatuongelmista ja tuloksista, erottele havainnot oletuksista ja viittaa niitä tukeviin tiedostoihin.
Sisältö
Taidot
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 lisää
Resurssit
Lisää Life Sciences NGS Analysis -lisäosa muutamalla klikkauksella
Saatavuus riippuu lisäosasta, tilauksestasi ja työtilan asetuksista. Jotkin yhteydet edellyttävät ylläpitäjän määritystä tai hyväksyntää. Ota yhteyttä työtilasi ylläpitäjään, jos käyttöoikeus on estetty.
Tutustu aiheeseen liittyviin lisäosiin
Data
Muunna data selkeiksi päätöksiksi.
Life Sciences Literature
Etsi biolääketieteen artikkeleita, esipainoksia ja avoimia kokotekstejä
NGS Analysis Workbench
Analysoi sekvensointidataa
BioRender
Etsi ja luo kuvia
Documents
Luo ja muokkaa asiakirjoja
Zotero
Etsi tutkimusartikkeleita ja lisää lähdeviitteitä Zoterosta
