- Funktsioonid
- Interactive, Read, Write
- Kategooria
- Andmed
- Arendaja
- OpenAI
- Veebisait
- (avaneb uues aknas)
Kuidas see töötab
NGS-i töökeskkond, mis toetab kogu analüüsiprotsessi: FASTQ kvaliteedikontrolli, rakupopulatsiooni RNA-seq-i ja üksikraku RNA-seq-i. Spetsialiseeritud oskused selgitavad välja kasutaja lähteolukorra, kavandavad teaduslikule tulemusele suunatud analüüsi, seovad selle Nextflow/nf-core’i või Snakemake’i saadaolevate võimalustega, säilitavad kontrollsummaga seotud süsteemisisese heakskiidu ning tõlgendavad valminud tulemusi failides talletatud tõendusmaterjali põhjal.
Mida veel saad teha?
Hinda sekveneerimise kvaliteeti
NGS Analysis Workbench, vaata need sekveneerimise sisendandmed üle ja täpsusta analüüsi eesmärki. Vali toetatud kvaliteedikontrolli töövoog, kontrolli eeldusi ning tõlgenda valminud aruandeid salvestatud väljundite põhjal.
Kavanda RNA sekveneerimisandmete analüüs
NGS Analysis Workbench, vaata üle selle rakupopulatsiooni RNA-seq-uuringu sisendandmed ja kavand. Soovita toetatud analüüsitöövoogu, tuvasta puuduvad metaandmed ja selgita, mida tuleb enne käivitamist kontrollida.
Tõlgenda sekveneerimistulemusi
NGS Analysis Workbench, vaata üle need lõpetatud sekveneerimisanalüüsi väljundid. Võta kokku kvaliteediprobleemid ja tulemused, erista leiud oletustest ning viita neid toetavatele failidele.
Mida see sisaldab
Oskused
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Ressursid
Lisa plugin NGS Analysis Workbench paari klõpsuga
Saadavus sõltub pistikprogrammist, sinu paketist ja tööruumi seadetest. Mõned ühendused nõuavad administraatori seadistamist või heakskiitu. Kui juurdepääs on blokeeritud, võta ühendust oma tööruumi administraatoriga.
Sirvi seotud pluginaid
Data
Tee andmete põhjal selgeid otsuseid.
Life Sciences Literature
Leia biomeditsiiniartikleid, eeltrükke ja avatud juurdepääsuga täistekste
Life Sciences NGS Analysis
Juhendatud NGS-i töövoo valik ja sekveneerimisanalüüsi kohalik käitamine
BioRender
Leidke ja looge jooniseid
Documents
Dokumentide loomine ja muutmine
Zotero
Leia Zoterost teadusartikleid ja lisa viiteid
