Life Sciences NGS Analysis
Juhendatud NGS-i töövoo valik ja sekveneerimisanalüüsi kohalik käitamine
- Funktsioonid
- Interactive, Read, Write
- Kategooria
- Haridus
- Arendaja
- OpenAI
- Veebisait
- (avaneb uues aknas)
Kuidas see töötab
Juhendatud sisendandmete kogumise, töövoo valiku ja käitamise plugin järgmise põlvkonna sekveneerimise töövoogudele. See aitab Codexil uurida kohalikke sekveneerimissisendeid, küsida ainult puuduvaid analüüsispetsiifilisi küsimusi, valida võimaluse korral avalikke või tasuta kättesaadavaid käitusajal installitavaid pakette, kontrollida enne installimist olemasolevate tööriistade saadavust ning käitada toetatud kohalikke töövooge koos valideerimise, logide, manifestide, kvaliteedikontrolli aruannete ja artefaktide registritega. See hõlmab põhjalikumaid otsustusoskusi BCL-i demultipleksimiseks, FASTQ kvaliteedikontrolli käitamiseks ja tõlgendamiseks, iduliini, somaatiliste ja UMI-paneeli DNA variantide analüüsiks, RNA kogusekveneerimise loenduste genereerimiseks ja diferentsiaalse ekspressiooni analüüsiks, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag analüüsiks ning sisseehitatud loendusjärgseks scRNA-seq kvaliteedikontrolliks.
Mida veel saad teha?
Kontrolli sekveneerimise kvaliteeti
Eluteaduste NGS-analüüs. Uuri neid sekveneerimissisendeid ja täpsusta analüüsi eesmärki. Vali toetatud kvaliteedikontrolli töövoog, kontrolli eeltingimusi ja tõlgenda valminud aruandeid koos salvestatud artefaktidega.
Kavanda RNA sekveneerimise analüüs
Eluteaduste NGS-analüüs. Vaata üle selle RNA kogusekveneerimise uuringu sisendid ja ülesehitus. Soovita toetatud analüüsitöövoogu, tuvasta puuduvad metaandmed ja selgita enne käitamist vajalikke kontrolle.
Tõlgenda sekveneerimistulemusi
Eluteaduste NGS-analüüs. Vaata üle need lõpetatud sekveneerimisanalüüsi väljundid. Võta kokku kvaliteediprobleemid ja tulemused, erista järeldusi eeldustest ning viita neid toetavatele failidele.
Mida see sisaldab
Oskused
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 rohkem
Ressursid
Lisa plugin Life Sciences NGS Analysis paari klõpsuga
Saadavus sõltub pistikprogrammist, sinu paketist ja tööruumi seadetest. Mõned ühendused nõuavad administraatori seadistamist või heakskiitu. Kui juurdepääs on blokeeritud, võta ühendust oma tööruumi administraatoriga.
Sirvi seotud pluginaid
Data
Tee andmete põhjal selgeid otsuseid.
Life Sciences Literature
Leia biomeditsiiniartikleid, eeltrükke ja avatud juurdepääsuga täistekste
NGS Analysis Workbench
Analüüsi sekveneerimisandmeid
BioRender
Leidke ja looge jooniseid
Documents
Dokumentide loomine ja muutmine
Zotero
Leia Zoterost teadusartikleid ja lisa viiteid
