Παρουσιάζουμε νέες δυνατότητες για το GPT‑Rosalind
Περισσότερη νοημοσύνη, θεμελιωμένη σε πραγματικές επιστημονικές ροές εργασίας για τον κλάδο των βιοεπιστημών.
Παρουσιάζουμε μια νέα ενημέρωση μοντέλου στη σειρά GPT‑Rosalind, ειδικά σχεδιασμένη για έρευνα στις βιοεπιστήμες σε επιχειρησιακή κλίμακα. Συνδυάζει τις δυνατότητες προγραμματισμού βάσει πράκτορα και χρήσης εργαλείων του GPT‑5.5 με ισχυρότερη νοημοσύνη μοντέλου σε βασικούς τομείς ανακάλυψης φαρμάκων, όπως η φαρμακευτική χημεία και η γονιδιωματική, ενώ προωθεί την απόδοση σε ευρύτερες αναλύσεις, σχεδιασμό και πειραματικές ροές εργασίας των βιοεπιστημών.
Η πρόοδος στις βιοεπιστήμες εξαρτάται από τη σύνθεση δεδομένων και τεκμηρίων σε κλίμακες και τρόπους: μόρια, γονίδια, μονοπάτια και ζωντανά συστήματα. Στις αξιολογήσεις μας, το ενημερωμένο GPT‑Rosalind δείχνει ευρείες βελτιώσεις απόδοσης σε ερευνητικές εργασίες από ειδικούς βιολογίας, σύνθετα ερωτήματα φαρμακευτικής χημείας, ποσοτική βιολογία και αντιμετώπιση προβλημάτων wet lab.
Το GPT‑Rosalind είναι πλέον διαθέσιμο σε προεπισκόπηση έρευνας σε επιλέξιμους οργανισμούς παγκοσμίως μέσω της δομής ανάπτυξης με αξιόπιστη πρόσβαση.
Για να μετράμε και να βελτιώνουμε συνεχώς τον πραγματικό αντίκτυπο του GPT‑Rosalind, σχεδιάσαμε το LifeSciBench, ένα benchmark που κρίνεται από εξωτερικούς ειδικούς και εστιάζει σε θεμελιώδεις πτυχές της έρευνας στις βιοεπιστήμες. Σε αντίθεση με τα υπάρχοντα benchmark που αξιολογούν μεμονωμένα ένα στοιχείο της απόδοσης μοντέλου ή έναν βιολογικό τομέα, το LifeSciBench εξετάζει από άκρο σε άκρο την επιστημονικά πολύτιμη εργασία, αντλώντας εργασίες από έξι περιοχές ροής εργασίας κεντρικές στην έρευνα βιοεπιστημών: διαχείριση τεκμηρίων, ανάλυση, σχεδιασμό και βελτιστοποίηση, επιστημονική συλλογιστική, επικύρωση και λειτουργίες, και μετάφραση και επικοινωνία. Χρησιμοποιούμε αυτό το benchmark για να ευθυγραμμίζουμε την πρόοδο με τις ανάγκες και την πραγματικότητα της έρευνας στις βιοεπιστήμες.
Το GPT‑Rosalind ηγείται στην απόδοση σε επιστημονικά πολύτιμες εργασίες που εντοπίστηκαν από ειδικούς της βιομηχανίας και της ακαδημαϊκής κοινότητας.
Το GPT‑Rosalind επιτυγχάνει κορυφαία απόδοση στον κλάδο στη φαρμακευτική χημεία, έναν τομέα που εστιάζει στη μετατροπή μορίων σε χρήσιμα φάρμακα. Σχεδιάσαμε το MedChemBench ώστε να αντικατοπτρίζει ρεαλιστικές ροές εργασίας φαρμακευτικής χημείας, αξιολογώντας την κατανόηση πολυτροπικών χημικών δομών, τη σχέση δομής-δραστικότητας (SAR), την πρόβλεψη ισχύος, τοξικότητας και απορρόφησης, κατανομής, μεταβολισμού και απέκκρισης (ADME) φαρμάκων, τη λήψη αποφάσεων βελτιστοποίησης lead πολλαπλών παραμέτρων και την ρετροσύνθεση. Το GPT‑Rosalind ξεπερνά το GPT‑5.5 με 27,5% έναντι 25,1% στο MedChemBench, χρησιμοποιώντας 7,2% λιγότερα token.
Το GPT‑Rosalind δείχνει καλύτερη πολυτροπική σύνθεση και μηχανιστική συλλογιστική στη φαρμακευτική χημεία.
Στο GeneBench, την πρακτορική αξιολόγησή μας για μακρού ορίζοντα, από άκρο σε άκρο ανάλυση στη γονιδιωματική και την ποσοτική βιολογία, το GPT‑Rosalind χρησιμοποιεί 31% λιγότερα token από το GPT‑5.5, επιτυγχάνοντας υψηλότερη ακρίβεια 21,6% έναντι 20,4%. Το GeneBench αξιολογεί την πρακτορική απόδοση σε ποσοτικές εργασίες μακρού ορίζοντα: βάσει ρεαλιστικών επιστημονικών δεδομένων, μπορεί ένας πράκτορας να σχεδιάσει έγκυρη ανάλυση, QC, μοντελοποίηση και διορθώσεις για να καταλήξει σε απαντήσεις σχετικές με αποφάσεις; Τα προβλήματα που περιλαμβάνονται καλύπτουν ποικίλους τομείς, όπως λειτουργική γονιδιωματική, χωρική μεταγραφωμική, πρωτεωμική, επιγονιδιωματική και εφαρμοσμένη γενετική.
Το GPT‑Rosalind χρησιμοποιεί 31% λιγότερα token από το GPT‑5.5, βελτιώνοντας παράλληλα την ακρίβεια.
Παρουσιάζουμε μια νέα αξιολόγηση για να δοκιμάσουμε την ικανότητα του GPT‑Rosalind να βοηθά επιστήμονες που εκτελούν εργαστηριακή εργασία στον πραγματικό κόσμο. Το LabWorkBench δοκιμάζει την ικανότητα του μοντέλου να συνδέει διαταραχές με πειραματικά αποτελέσματα σε πραγματικά πρωτόκολλα wet lab που χρησιμοποιούν οι επιστήμονες, για σκοπούς από την αντιμετώπιση προβλημάτων έως τη βελτιστοποίηση. Τα δεδομένα που χρησιμοποιεί το LabWorkBench είναι ιδιόκτητα και, συνεπώς, μη επιμολυσμένα. Το GPT‑Rosalind σημειώνει 63,2% έναντι 55,8% του GPT‑5.5, χρησιμοποιώντας 5,3% λιγότερα token.
Σε πραγματική υποστήριξη πρωτοκόλλων wet lab, το GPT‑Rosalind δείχνει σημαντική βελτίωση έναντι του GPT‑5.5, ενώ βελτιώνει την αποδοτικότητα των token.
Δημιουργήσαμε τα πρόσθετα Life Sciences Research(ανοίγει σε νέο παράθυρο) και Life Sciences NGS Analysis(ανοίγει σε νέο παράθυρο) για να επεκτείνουμε την αυξημένη νοημοσύνη του GPT‑Rosalind με ένα πρακτικό επίπεδο εκτέλεσης για επαναλήψιμες επιστημονικές ροές εργασίας. Μαζί, αυτά τα πρόσθετα φέρνουν την ανάκτηση τεκμηρίων με πηγές, τη βιολογική ερμηνεία και τη βιοπληροφορική εκτέλεση στον ίδιο χώρο εργασίας, βοηθώντας τους ερευνητές να συνδέουν εξωτερικά τεκμήρια με εσωτερικές αναλύσεις omics, διατηρώντας artifacts και προέλευση. Όλοι οι χρήστες μπορούν πλέον να έχουν πρόσβαση και στα δύο πρόσθετα μέσω του Codex. Οι πιστοποιημένοι εταιρικοί χρήστες του GPT‑Rosalind μπορούν επιπλέον να χρησιμοποιούν το GPT‑Rosalind για την τροφοδότηση αυτών των προσθέτων.
Για να αξιοποιήσουμε καλύτερα το Codex ως δυναμικό πάγκο εργασίας για επιστήμονες, προσθέσαμε διαδραστικά προγράμματα προβολής για βιολογικά εγγενείς τύπους αρχείων. Το αρχικό σύνολο προβολέων αλληλουχίας, στοίχισης και δομής έχει σχεδιαστεί ώστε να κρατά τους επιστήμονες κοντά στα τεκμήρια, καθώς το GPT‑Rosalind συλλογίζεται σε μια ροή εργασίας και απαντά άμεσα σε επακόλουθες ερωτήσεις χρησιμοποιώντας τον ενεργό προβολέα εντός συμφραζομένων.
Η παραπάνω επίδειξη δείχνει αυτές τις δυνατότητες σε δράση, ενορχηστρωμένες από το GPT‑Rosalind. Παρακολουθούμε έναν επιστήμονα που διερευνά μια υγρή βιοψία όγκου για να εντοπίσει μεταλλάξεις και άλλες μοριακές αλλαγές που θα μπορούσαν να ενημερώσουν τη θεραπεία. Το πρόσθετο Life Sciences NGS Analysis μετατρέπει μια επισκόπηση επεξεργασμένων αρχείων ctDNA σε διαδραστικό notebook, αναδεικνύοντας επαναλαμβανόμενες αλλοιώσεις, κλήσεις χαμηλής συχνότητας και τροχιές δειγμάτων που εστιάζουν τη διερεύνηση στο KRAS G12C. Από εκεί, το πρόσθετο Life Sciences Research προσθέτει τεκμηριωμένο πλαίσιο για στόχο, αναστολέα και αντοχή, ενώ οι εγγενείς προβολείς αλληλουχίας, στοίχισης και δομής επιτρέπουν στον επιστήμονα να επιθεωρήσει άμεσα το μεταλλαγμένο υπόλειμμα 12, τη διατήρησή του στην οικογένεια RAS και τη θήκη δεσμευμένη στον αναστολέα. Η ροή εργασίας ολοκληρώνεται μεταφράζοντας αυτά τα τεκμήρια σε συγκεκριμένες επιλογές παρακολούθησης, με κάθε βήμα και artifact διαθέσιμο για αξιολόγηση από ειδικούς.
Πρόσθετο Life Sciences NGS Analysis
QC & επισημείωση scRNA-seq
Μετατρέψτε ένα πακέτο μήτρας τύπου 10x σε μονοκυτταρικά artifacts φιλτραρισμένα με QC, επισημειώσεις και UMAP που μπορείτε να επιθεωρήσετε και να αναθεωρήσετε στο Codex. Το πρόσθετο Life Sciences NGS Analysis δρομολογεί το αίτημα στο scrna-seq-qc, επιλέγει όρια QC από τα δεδομένα, διατηρεί την προέλευση γύρω από το φιλτράρισμα και την επισημείωση, και αναδεικνύει εμπόδια όπως ελλείπουσες εξαρτήσεις ανίχνευσης doublet.
QC FASTQ για bulk RNA-seq
Μετατρέψτε ένα φύλλο δειγμάτων bulk RNA-seq, ένα πακέτο FASTQ και αρχεία αναφοράς σε πακέτο μετρήσεων ελεγμένο με QC, που μπορείτε να επιθεωρήσετε και να επαναχρησιμοποιήσετε στο Codex. Το πρόσθετο Life Sciences NGS Analysis δρομολογεί το αίτημα, επικυρώνει τα δεδομένα εισόδου και επιστρέφει έναν ελέγξιμο φάκελο εκτέλεσης με MultiQC, πίνακες Salmon, προέλευση και ρητές επιφυλάξεις.
Επεκτείνουμε την πρόσβαση στη σειρά GPT‑Rosalind σε επιλέξιμους οργανισμούς παγκοσμίως. Το GPT‑Rosalind θα είναι διαθέσιμο σε προεπισκόπηση έρευνας μέσω της δομής ανάπτυξης αξιόπιστης πρόσβασης για οργανισμούς που διεξάγουν νόμιμη επιστημονική έρευνα με σαφές δημόσιο όφελος, διαθέτουν ισχυρή διακυβέρνηση και εποπτεία ασφάλειας, καθώς και ελεγχόμενη πρόσβαση με ασφάλεια εταιρικού επιπέδου.
Στο πλαίσιο αυτής της παγκόσμιας επέκτασης, είμαστε ενθουσιασμένοι που βοηθάμε να υποστηριχθεί η αποστολή της Novo Nordisk να φέρνει ταχύτερα καινοτόμες θεραπευτικές επιλογές στους ασθενείς, βοηθώντας στην κλιμάκωση της ιατρικής της έρευνας με το GPT‑Rosalind. Η Novo Nordisk αξιοποιεί προηγμένες δυνατότητες ΤΝ για να βοηθήσει τους ερευνητές να αναλύουν σύνθετα σύνολα δεδομένων, να αποκαλύπτουν χρήσιμα μοτίβα και να δοκιμάζουν υποθέσεις πιο γρήγορα. Η ισχυρότερη βιολογική κατανόηση του GPT‑Rosalind θα βοηθήσει τις ομάδες να συνδέουν τεκμήρια από βιβλιογραφία, γονιδιωματική, μεταγραφωμική, αλληλουχία, δομή και πειραματικά αποτελέσματα, διευκολύνοντας τη μετάβαση από τα δεδομένα σε σαφέστερες ερευνητικές αποφάσεις.
«Η έρευνα στις βιοεπιστήμες είναι σύνθετη, πλούσια σε δεδομένα και διεπιστημονική. Για να προσφέρουν ουσιαστική αξία στους ερευνητές, τα προηγμένα μοντέλα ΤΝ πρέπει να θεμελιώνονται σε αξιόπιστα επιστημονικά δεδομένα, να συνδέονται με επικυρωμένα εργαλεία και να ενσωματώνονται στις πραγματικές ροές εργασίας που χρησιμοποιούν οι ερευνητές καθημερινά. Είμαστε ικανοποιημένοι με τη συνεργασία μας με την OpenAI και την ευκαιρία να διερευνήσουμε πώς το GPT‑Rosalind μπορεί να υποστηρίξει πιο αυστηρές, πρακτικές προσεγγίσεις στην ανακάλυψη φαρμάκων.»
Mishal Patel, Group Vice President, ΤΝ & Ψηφιακή Καινοτομία, R&D - Novo Nordisk
Προσφέρουμε επίσης πλέον έναν διαχειριζόμενο από την OpenAI χώρο εργασίας για πιστοποιημένους οργανισμούς χωρίς λογαριασμό Enterprise.
Το ενημερωμένο GPT‑Rosalind είναι το επόμενο βήμα στην ευρύτερη δέσμευσή μας να δημιουργούμε συστήματα ΤΝ που μπορούν να βοηθούν στην επιτάχυνση της επιστημονικής ανακάλυψης, διασφαλίζοντας παράλληλα ότι οι προηγμένες βιολογικές δυνατότητες αναπτύσσονται με κατάλληλες διασφαλίσεις. Θα συνεχίσουμε να βελτιώνουμε τη βιολογική συλλογιστική του μοντέλου, να επεκτείνουμε την υποστήριξη για ροές εργασίας έρευνας με πολλά εργαλεία και μακρό ορίζοντα, και να συνεργαζόμαστε με πιστοποιημένους οργανισμούς σε διάφορες περιοχές για να αξιολογούμε τον πραγματικό αντίκτυπο.
Αυτό σημαίνει επίσης εφαρμογή της ΤΝ βιοεπιστημών σε εργασίες υψηλού αντικτύπου για το δημόσιο όφελος, από την ανακάλυψη φαρμάκων και τη μεταφραστική ιατρική έως τη δημόσια υγεία, την ετοιμότητα και τη βιοάμυνα. Μέσω του Rosalind Biodefense και του μοντέλου ανάπτυξης αξιόπιστης πρόσβασης, στοχεύουμε να θέσουμε προηγμένες βιολογικές δυνατότητες στα χέρια των ερευνητών, των ιδρυμάτων και των υπερασπιστών που εργάζονται για τη βελτίωση της ανθρώπινης υγείας και την ενίσχυση της κοινωνικής ανθεκτικότητας.
Θα συνεχίσουμε να αναπτύσσουμε το GPT‑Rosalind ώστε να γίνει πιο ικανός συνεργάτης σε όλο τον κύκλο ζωής της επιστημονικής έρευνας, βοηθώντας τους επιστήμονες να μεταβαίνουν πιο γρήγορα από τις σωστές ερωτήσεις σε σαφέστερα τεκμήρια, καλύτερα πειράματα και τελικά νέες θεραπείες για τους ασθενείς.
