Life Sciences NGS Analysis
Καθοδηγούμενη δρομολόγηση NGS και τοπική εκτέλεση για ανάλυση αλληλούχισης
- Δυνατότητες
- Interactive, Read, Write
- Κατηγορία
- Εκπαίδευση
- Προγραμματιστής
- OpenAI
- Ιστότοπος
- (ανοίγει σε νέο παράθυρο)
Πώς λειτουργεί
Ένα plugin καθοδηγούμενης συλλογής στοιχείων, δρομολόγησης και εκτέλεσης για ροές εργασίας αλληλούχισης νέας γενιάς. Βοηθά το Codex να εξετάζει τοπικά δεδομένα αλληλούχισης, να θέτει μόνο τις ερωτήσεις που λείπουν για τη συγκεκριμένη δοκιμασία, να επιλέγει όπου είναι δυνατό δημόσια ή δωρεάν προσβάσιμα πακέτα που εγκαθίστανται κατά την εκτέλεση, να ελέγχει τη διαθεσιμότητα εργαλείων πριν από κάθε εγκατάσταση και να εκτελεί υποστηριζόμενες τοπικές ροές εργασίας με επικύρωση, αρχεία καταγραφής, δηλωτικά, αναφορές QC και ευρετήρια παραγόμενων αρχείων. Περιλαμβάνει προηγμένες δυνατότητες λήψης αποφάσεων για αποπολυπλεξία BCL, εκτέλεση και ερμηνεία QC αρχείων FASTQ, παραλλαγές DNA βλαστικής σειράς, σωματικές παραλλαγές και παραλλαγές σε πάνελ UMI, παραγωγή μετρήσεων και διαφορική έκφραση σε bulk RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag, καθώς και ενσωματωμένο QC μετά την καταμέτρηση για scRNA-seq.
Τι άλλο μπορείτε να κάνετε;
Έλεγχος ποιότητας αλληλούχισης
Ανάλυση NGS Βιοεπιστημών: Εξέτασε αυτά τα δεδομένα αλληλούχισης και διευκρίνισε τον στόχο της ανάλυσης. Επίλεξε μια υποστηριζόμενη ροή QC, έλεγξε τις προϋποθέσεις και ερμήνευσε τις ολοκληρωμένες αναφορές και τα αποθηκευμένα αρχεία.
Σχεδιασμός ανάλυσης αλληλούχισης RNA
Ανάλυση NGS Βιοεπιστημών: Εξέτασε τα δεδομένα εισόδου και τον σχεδιασμό αυτής της μελέτης bulk RNA-seq. Πρότεινε μια υποστηριζόμενη ροή ανάλυσης, εντόπισε τα μεταδεδομένα που λείπουν και εξήγησε τους ελέγχους που απαιτούνται πριν από την εκτέλεση.
Ερμηνεία αποτελεσμάτων αλληλούχισης
Ανάλυση NGS Βιοεπιστημών: Εξέτασε αυτά τα ολοκληρωμένα αποτελέσματα ανάλυσης αλληλούχισης. Συνόψισε τα ζητήματα ποιότητας και τα αποτελέσματα, διάκρινε τα ευρήματα από τις παραδοχές και παράπεμψε στα σχετικά αρχεία.
Τι περιλαμβάνεται
Skill
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 περισσότερα
Πόροι
Προσθέστε το plugin Life Sciences NGS Analysis με λίγα μόνο κλικ
Η διαθεσιμότητα εξαρτάται από το plugin, το πρόγραμμά σας και τις ρυθμίσεις του χώρου εργασίας. Ορισμένες συνδέσεις απαιτούν διαμόρφωση από διαχειριστή ή την έγκρισή του. Επικοινωνήστε με τον διαχειριστή του χώρου εργασίας σας, αν η πρόσβαση έχει αποκλειστεί.
Ανακαλύψτε σχετικά plugin
Data
Μετατρέψτε τα δεδομένα σε σαφείς αποφάσεις.
Life Sciences Literature
Βρείτε βιοϊατρικές εργασίες, προδημοσιεύσεις και πλήρες κείμενο ανοικτής πρόσβασης
NGS Analysis Workbench
Αναλύστε δεδομένα αλληλούχησης
BioRender
Βρείτε και δημιουργήστε σχήματα
Documents
Δημιουργία και επεξεργασία εγγράφων
Zotero
Βρείτε μελέτες και προσθέστε παραπομπές από το Zotero
