NGS Analysis Workbench

Analysér sekventeringsdata

Installer plugin Kontakt salgsafdelingen

Kapabiliteter: Interactive, Read, Write
Kategori: Data
Udvikler: OpenAI
Website: (åbner i et nyt vindue)

NGS Analysis Workbench Kør kvalitetskontrol med FastQC og Salmon på et offentligt RNA-seq-datasæt, og giv en fortolkning af resultaterne.

Sådan fungerer det

Et NGS-analyseværktøj til hele forløbet med kvalitetskontrol af FASTQ, bulk-RNA-seq og enkeltcelle-RNA-seq. Målrettede funktioner afdækker brugerens udgangspunkt, tilrettelægger analysen mod et videnskabeligt mål, kobler designet til tilgængelige funktioner i Nextflow/nf-core eller Snakemake, bevarer systemets egen godkendelse knyttet til kontrolsummer og fortolker færdige resultater ud fra dokumentation i filer.

Hvad kan du ellers gøre?

Vurdér sekventeringskvaliteten
NGS Analysis Workbench Undersøg disse sekventeringsdata, og afklar analysens mål. Vælg en understøttet QC-workflow, kontrollér forudsætningerne, og fortolk de færdige rapporter ud fra gemte filer.
Prøv det i ChatGPT Work(åbner i et nyt vindue)
Planlæg RNA-sekventeringsanalysen
NGS Analysis Workbench Gennemgå inputdata og design for dette bulk-RNA-seq-studie. Anbefal en understøttet analyseworkflow, identificér manglende metadata, og forklar, hvilke kontroller der er nødvendige før kørsel.
Prøv det i ChatGPT Work(åbner i et nyt vindue)
Fortolk sekventeringsresultaterne
NGS Analysis Workbench Gennemgå disse færdige resultater fra sekventeringsanalyser. Opsummér kvalitetsproblemer og resultater, skeln mellem fund og antagelser, og henvis til de filer, der dokumenterer dem.
Prøv det i ChatGPT Work(åbner i et nyt vindue)

Hvad er inkluderet

Færdigheder

Design NGS Analysis
NGS Analysis Workbench
Run NGS Analysis
Understand NGS Data
Understand NGS Results

Ressourcer

Tilføj plugin NGS Analysis Workbench med nogle få klik

Gennemse plugins, der understøtter dit teams værktøjer og opgaver.

Oversigt over ChatGPT-plugins, der viser Google Drive, Slack og Google Calendar.

Installér plugin'et, og følg derefter prompterne for at gennemgå tilladelser og forbinde eventuelle nødvendige apps.

Start en ny chat i ChatGPT Work eller Codex, beskriv det resultat, du har brug for, og bed den om at bruge plugins.

Tilgængeligheden afhænger af plugin'et, dit abonnement og indstillingerne for arbejdsområdet. Nogle forbindelser kræver opsætning eller godkendelse af en administrator. Kontakt administratoren for dit arbejdsområde, hvis adgang er blokeret.

Vis opsætningsvejledningen